Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKE2

Trem1, Triggering receptor expressed on myeloid cells 1, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem1Q9JKE2 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 CT009713.5-203ENSMUST00000224218 2079 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 C2cd5-213ENSMUST00000204655 3526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Zfp148-202ENSMUST00000165418 9431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Olfr742-203ENSMUST00000217437 2244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 CT009713.10-201ENSMUST00000225013 1986 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 C2cd5-204ENSMUST00000203187 3494 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Esr2-202ENSMUST00000101291 3362 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Trem1Q9JKE2 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trem1Q9JKE2 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trem1Q9JKE2 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Trem1Q9JKE2 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trem1Q9JKE2 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Trem1Q9JKE2 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trem1Q9JKE2 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trem1Q9JKE2 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Trem1Q9JKE2 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Trem1Q9JKE2 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms