Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIL2

Ccl28, C-C motif chemokine 28, mousemouse

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Length 130 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl28Q9JIL2 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Ccl28Q9JIL2 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
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Ccl28Q9JIL2 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Glod4-201ENSMUST00000017430 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
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Ccl28Q9JIL2 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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Ccl28Q9JIL2 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Ccl28Q9JIL2 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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