Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERR7

Selenof, Selenoprotein F, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelenofQ9ERR7 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SelenofQ9ERR7 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SelenofQ9ERR7 Asb8-204ENSMUST00000143400 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SelenofQ9ERR7 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SelenofQ9ERR7 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
SelenofQ9ERR7 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SelenofQ9ERR7 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SelenofQ9ERR7 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SelenofQ9ERR7 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SelenofQ9ERR7 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SelenofQ9ERR7 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SelenofQ9ERR7 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SelenofQ9ERR7 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SelenofQ9ERR7 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SelenofQ9ERR7 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SelenofQ9ERR7 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SelenofQ9ERR7 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SelenofQ9ERR7 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SelenofQ9ERR7 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SelenofQ9ERR7 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
SelenofQ9ERR7 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SelenofQ9ERR7 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SelenofQ9ERR7 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SelenofQ9ERR7 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SelenofQ9ERR7 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SelenofQ9ERR7 Srp54a-202ENSMUST00000220578 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SelenofQ9ERR7 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SelenofQ9ERR7 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SelenofQ9ERR7 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SelenofQ9ERR7 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SelenofQ9ERR7 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SelenofQ9ERR7 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SelenofQ9ERR7 Kir3dl2-202ENSMUST00000113108 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SelenofQ9ERR7 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SelenofQ9ERR7 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SelenofQ9ERR7 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC10.72□□□□□ -0.69
SelenofQ9ERR7 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SelenofQ9ERR7 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SelenofQ9ERR7 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SelenofQ9ERR7 Sass6-204ENSMUST00000197335 2458 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SelenofQ9ERR7 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
SelenofQ9ERR7 Acsf3-202ENSMUST00000212781 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
SelenofQ9ERR7 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SelenofQ9ERR7 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SelenofQ9ERR7 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
SelenofQ9ERR7 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
SelenofQ9ERR7 Chrd-201ENSMUST00000007171 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SelenofQ9ERR7 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SelenofQ9ERR7 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SelenofQ9ERR7 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SelenofQ9ERR7 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SelenofQ9ERR7 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SelenofQ9ERR7 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
SelenofQ9ERR7 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SelenofQ9ERR7 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
SelenofQ9ERR7 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
SelenofQ9ERR7 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
SelenofQ9ERR7 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
SelenofQ9ERR7 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SelenofQ9ERR7 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
SelenofQ9ERR7 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
SelenofQ9ERR7 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
SelenofQ9ERR7 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
SelenofQ9ERR7 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SelenofQ9ERR7 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
SelenofQ9ERR7 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
SelenofQ9ERR7 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
SelenofQ9ERR7 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SelenofQ9ERR7 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SelenofQ9ERR7 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SelenofQ9ERR7 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SelenofQ9ERR7 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
SelenofQ9ERR7 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SelenofQ9ERR7 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SelenofQ9ERR7 Sp6-201ENSMUST00000047997 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SelenofQ9ERR7 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SelenofQ9ERR7 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SelenofQ9ERR7 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SelenofQ9ERR7 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
SelenofQ9ERR7 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
SelenofQ9ERR7 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
SelenofQ9ERR7 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.7
SelenofQ9ERR7 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
SelenofQ9ERR7 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
SelenofQ9ERR7 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
SelenofQ9ERR7 Gmppb-202ENSMUST00000112295 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
SelenofQ9ERR7 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.7
SelenofQ9ERR7 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
SelenofQ9ERR7 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
SelenofQ9ERR7 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
SelenofQ9ERR7 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SelenofQ9ERR7 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SelenofQ9ERR7 Bcl2l13-201ENSMUST00000009256 6925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SelenofQ9ERR7 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SelenofQ9ERR7 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SelenofQ9ERR7 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SelenofQ9ERR7 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SelenofQ9ERR7 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SelenofQ9ERR7 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
SelenofQ9ERR7 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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