Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER42

Barx1, Homeobox protein BarH-like 1, mousemouse

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Length 254 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Barx1Q9ER42 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Barx1Q9ER42 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Barx1Q9ER42 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Barx1Q9ER42 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Barx1Q9ER42 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Barx1Q9ER42 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Barx1Q9ER42 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Barx1Q9ER42 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Barx1Q9ER42 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Barx1Q9ER42 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Barx1Q9ER42 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Barx1Q9ER42 Gm28840-208ENSMUST00000191514 738 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Barx1Q9ER42 Gm3402-201ENSMUST00000036715 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Barx1Q9ER42 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Barx1Q9ER42 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Barx1Q9ER42 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Barx1Q9ER42 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Barx1Q9ER42 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Barx1Q9ER42 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Barx1Q9ER42 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Barx1Q9ER42 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Barx1Q9ER42 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Barx1Q9ER42 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Barx1Q9ER42 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Barx1Q9ER42 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Barx1Q9ER42 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Barx1Q9ER42 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Barx1Q9ER42 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Barx1Q9ER42 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Barx1Q9ER42 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Barx1Q9ER42 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Barx1Q9ER42 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Barx1Q9ER42 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Barx1Q9ER42 Tmem19-206ENSMUST00000218731 1346 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Barx1Q9ER42 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Barx1Q9ER42 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Barx1Q9ER42 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Barx1Q9ER42 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Barx1Q9ER42 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Barx1Q9ER42 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Barx1Q9ER42 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Barx1Q9ER42 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Barx1Q9ER42 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Barx1Q9ER42 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Barx1Q9ER42 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Barx1Q9ER42 Armcx1-201ENSMUST00000035748 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Barx1Q9ER42 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Barx1Q9ER42 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Barx1Q9ER42 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Barx1Q9ER42 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Barx1Q9ER42 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Barx1Q9ER42 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Barx1Q9ER42 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Barx1Q9ER42 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Barx1Q9ER42 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Barx1Q9ER42 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms