Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBZ9

Syde1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, mousemouse

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Length 737 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde1Q9DBZ9 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Syde1Q9DBZ9 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Syde1Q9DBZ9 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Syde1Q9DBZ9 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Syde1Q9DBZ9 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Syde1Q9DBZ9 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Syde1Q9DBZ9 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Syde1Q9DBZ9 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Syde1Q9DBZ9 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Syde1Q9DBZ9 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Syde1Q9DBZ9 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Syde1Q9DBZ9 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Syde1Q9DBZ9 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Syde1Q9DBZ9 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Syde1Q9DBZ9 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Syde1Q9DBZ9 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Syde1Q9DBZ9 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Syde1Q9DBZ9 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Syde1Q9DBZ9 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Syde1Q9DBZ9 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Syde1Q9DBZ9 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Syde1Q9DBZ9 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Syde1Q9DBZ9 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Syde1Q9DBZ9 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Syde1Q9DBZ9 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Syde1Q9DBZ9 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Syde1Q9DBZ9 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Syde1Q9DBZ9 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Syde1Q9DBZ9 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Syde1Q9DBZ9 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Syde1Q9DBZ9 Ccs-201ENSMUST00000037246 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Syde1Q9DBZ9 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Syde1Q9DBZ9 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Syde1Q9DBZ9 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Syde1Q9DBZ9 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Syde1Q9DBZ9 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Syde1Q9DBZ9 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Syde1Q9DBZ9 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Syde1Q9DBZ9 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Syde1Q9DBZ9 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Syde1Q9DBZ9 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Syde1Q9DBZ9 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Syde1Q9DBZ9 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Syde1Q9DBZ9 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Syde1Q9DBZ9 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Syde1Q9DBZ9 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Syde1Q9DBZ9 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Syde1Q9DBZ9 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Syde1Q9DBZ9 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Syde1Q9DBZ9 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Syde1Q9DBZ9 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Syde1Q9DBZ9 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Syde1Q9DBZ9 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Syde1Q9DBZ9 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Syde1Q9DBZ9 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Syde1Q9DBZ9 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Syde1Q9DBZ9 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Syde1Q9DBZ9 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Syde1Q9DBZ9 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Syde1Q9DBZ9 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Syde1Q9DBZ9 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Syde1Q9DBZ9 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Syde1Q9DBZ9 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Syde1Q9DBZ9 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Syde1Q9DBZ9 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Syde1Q9DBZ9 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Syde1Q9DBZ9 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Syde1Q9DBZ9 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Syde1Q9DBZ9 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Syde1Q9DBZ9 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Syde1Q9DBZ9 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC13.9□□□□□ -0.19
Syde1Q9DBZ9 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Syde1Q9DBZ9 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Syde1Q9DBZ9 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Syde1Q9DBZ9 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Syde1Q9DBZ9 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Syde1Q9DBZ9 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Syde1Q9DBZ9 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Syde1Q9DBZ9 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Syde1Q9DBZ9 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Syde1Q9DBZ9 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Syde1Q9DBZ9 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Syde1Q9DBZ9 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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