Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU3

Riok3, Serine/threonine-protein kinase RIO3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 519 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riok3Q9DBU3 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Riok3Q9DBU3 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Riok3Q9DBU3 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Riok3Q9DBU3 Gm26818-201ENSMUST00000181367 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Riok3Q9DBU3 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Riok3Q9DBU3 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Riok3Q9DBU3 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Riok3Q9DBU3 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Riok3Q9DBU3 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Riok3Q9DBU3 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Riok3Q9DBU3 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Riok3Q9DBU3 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Riok3Q9DBU3 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Riok3Q9DBU3 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Riok3Q9DBU3 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Riok3Q9DBU3 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Riok3Q9DBU3 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Riok3Q9DBU3 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Riok3Q9DBU3 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Riok3Q9DBU3 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Riok3Q9DBU3 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Riok3Q9DBU3 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Riok3Q9DBU3 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Riok3Q9DBU3 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Riok3Q9DBU3 Gm23819-201ENSMUST00000158744 109 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Riok3Q9DBU3 Erg-209ENSMUST00000177450 1280 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Riok3Q9DBU3 Gm28217-201ENSMUST00000188613 648 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Riok3Q9DBU3 Gm38343-201ENSMUST00000195786 1060 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Riok3Q9DBU3 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Riok3Q9DBU3 Cnn3-203ENSMUST00000197135 1242 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Riok3Q9DBU3 Tsg101-ps-201ENSMUST00000201023 1170 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Riok3Q9DBU3 Gm18414-201ENSMUST00000210858 694 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Riok3Q9DBU3 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Riok3Q9DBU3 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Riok3Q9DBU3 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Riok3Q9DBU3 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Riok3Q9DBU3 Gm23102-201ENSMUST00000083724 116 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Riok3Q9DBU3 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Riok3Q9DBU3 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Riok3Q9DBU3 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Riok3Q9DBU3 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Riok3Q9DBU3 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Riok3Q9DBU3 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Riok3Q9DBU3 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Riok3Q9DBU3 mt-Rnr2-201ENSMUST00000082390 1582 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Riok3Q9DBU3 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Riok3Q9DBU3 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Riok3Q9DBU3 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Riok3Q9DBU3 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Riok3Q9DBU3 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Riok3Q9DBU3 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Riok3Q9DBU3 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Riok3Q9DBU3 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Riok3Q9DBU3 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Riok3Q9DBU3 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Riok3Q9DBU3 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Riok3Q9DBU3 Gm29601-201ENSMUST00000187961 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Riok3Q9DBU3 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Riok3Q9DBU3 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Riok3Q9DBU3 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Riok3Q9DBU3 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Riok3Q9DBU3 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Riok3Q9DBU3 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Riok3Q9DBU3 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Riok3Q9DBU3 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Riok3Q9DBU3 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Riok3Q9DBU3 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Riok3Q9DBU3 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Riok3Q9DBU3 Gm2288-201ENSMUST00000118560 638 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Riok3Q9DBU3 Gm2318-201ENSMUST00000119623 639 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Riok3Q9DBU3 Gm5742-201ENSMUST00000120764 505 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Riok3Q9DBU3 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Riok3Q9DBU3 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Riok3Q9DBU3 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Riok3Q9DBU3 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Riok3Q9DBU3 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Riok3Q9DBU3 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Riok3Q9DBU3 Gm7438-201ENSMUST00000177664 639 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Riok3Q9DBU3 Gm7408-201ENSMUST00000178014 639 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Riok3Q9DBU3 Gm7386-201ENSMUST00000178020 639 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Riok3Q9DBU3 Gm3657-201ENSMUST00000178170 639 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Riok3Q9DBU3 Gm7415-201ENSMUST00000178205 639 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Riok3Q9DBU3 Gm7398-201ENSMUST00000178589 639 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Riok3Q9DBU3 Gm7391-201ENSMUST00000178680 639 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Riok3Q9DBU3 Gm7375-201ENSMUST00000179232 639 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Riok3Q9DBU3 Gm3681-201ENSMUST00000179940 639 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Riok3Q9DBU3 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Riok3Q9DBU3 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Riok3Q9DBU3 Gm18705-201ENSMUST00000215985 913 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Riok3Q9DBU3 4930401A07Rik-202ENSMUST00000216155 360 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Riok3Q9DBU3 Gm3213-201ENSMUST00000219296 441 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Riok3Q9DBU3 Gm10053-201ENSMUST00000073080 949 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Riok3Q9DBU3 Olfr846-201ENSMUST00000078774 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Riok3Q9DBU3 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Riok3Q9DBU3 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Riok3Q9DBU3 2900092N22Rik-201ENSMUST00000193601 1409 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Riok3Q9DBU3 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Riok3Q9DBU3 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Riok3Q9DBU3 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Riok3Q9DBU3 AC124675.1-201ENSMUST00000226263 1390 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.4 ms