Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB40

Med27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med27Q9DB40 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Med27Q9DB40 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Med27Q9DB40 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Med27Q9DB40 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Med27Q9DB40 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Med27Q9DB40 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Med27Q9DB40 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Med27Q9DB40 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Med27Q9DB40 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Med27Q9DB40 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Med27Q9DB40 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Med27Q9DB40 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Med27Q9DB40 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Med27Q9DB40 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Med27Q9DB40 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Med27Q9DB40 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Med27Q9DB40 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Med27Q9DB40 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Med27Q9DB40 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Med27Q9DB40 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Med27Q9DB40 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Med27Q9DB40 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Med27Q9DB40 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Med27Q9DB40 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Med27Q9DB40 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Med27Q9DB40 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Med27Q9DB40 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Med27Q9DB40 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Med27Q9DB40 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Med27Q9DB40 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Med27Q9DB40 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Med27Q9DB40 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Med27Q9DB40 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Med27Q9DB40 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Med27Q9DB40 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Med27Q9DB40 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Med27Q9DB40 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Med27Q9DB40 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Med27Q9DB40 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Med27Q9DB40 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Med27Q9DB40 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Med27Q9DB40 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Med27Q9DB40 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Med27Q9DB40 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Med27Q9DB40 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Med27Q9DB40 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Med27Q9DB40 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Med27Q9DB40 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Med27Q9DB40 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Med27Q9DB40 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Med27Q9DB40 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Med27Q9DB40 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Med27Q9DB40 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Med27Q9DB40 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Med27Q9DB40 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Med27Q9DB40 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Med27Q9DB40 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Med27Q9DB40 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Med27Q9DB40 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Med27Q9DB40 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Med27Q9DB40 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Med27Q9DB40 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Med27Q9DB40 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Med27Q9DB40 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Med27Q9DB40 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Med27Q9DB40 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Med27Q9DB40 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Med27Q9DB40 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Med27Q9DB40 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Med27Q9DB40 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Med27Q9DB40 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Med27Q9DB40 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Med27Q9DB40 Fgfr1-203ENSMUST00000119398 3789 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Med27Q9DB40 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Med27Q9DB40 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
Med27Q9DB40 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Med27Q9DB40 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
Med27Q9DB40 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Med27Q9DB40 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Med27Q9DB40 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Med27Q9DB40 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Med27Q9DB40 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Med27Q9DB40 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Med27Q9DB40 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Med27Q9DB40 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Med27Q9DB40 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Med27Q9DB40 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Med27Q9DB40 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Med27Q9DB40 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Med27Q9DB40 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Med27Q9DB40 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Med27Q9DB40 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Med27Q9DB40 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Med27Q9DB40 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Med27Q9DB40 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Med27Q9DB40 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Med27Q9DB40 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Med27Q9DB40 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Med27Q9DB40 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Med27Q9DB40 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms