Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB38

Znf580, Zinc finger protein 580, mousemouse

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Length 172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf580Q9DB38 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Znf580Q9DB38 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Znf580Q9DB38 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Znf580Q9DB38 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Znf580Q9DB38 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Znf580Q9DB38 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Znf580Q9DB38 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Znf580Q9DB38 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Znf580Q9DB38 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Znf580Q9DB38 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Znf580Q9DB38 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Znf580Q9DB38 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Znf580Q9DB38 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Znf580Q9DB38 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Znf580Q9DB38 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Znf580Q9DB38 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Znf580Q9DB38 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Znf580Q9DB38 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Znf580Q9DB38 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Znf580Q9DB38 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Znf580Q9DB38 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Znf580Q9DB38 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Znf580Q9DB38 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Znf580Q9DB38 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Znf580Q9DB38 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Znf580Q9DB38 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Znf580Q9DB38 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Znf580Q9DB38 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Znf580Q9DB38 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Znf580Q9DB38 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Znf580Q9DB38 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Znf580Q9DB38 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Znf580Q9DB38 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Znf580Q9DB38 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Znf580Q9DB38 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Znf580Q9DB38 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Znf580Q9DB38 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Znf580Q9DB38 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
Znf580Q9DB38 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Znf580Q9DB38 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Znf580Q9DB38 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Znf580Q9DB38 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
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Znf580Q9DB38 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
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Znf580Q9DB38 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Znf580Q9DB38 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Znf580Q9DB38 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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Znf580Q9DB38 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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Znf580Q9DB38 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Znf580Q9DB38 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Znf580Q9DB38 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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Znf580Q9DB38 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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Znf580Q9DB38 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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Znf580Q9DB38 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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Znf580Q9DB38 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Znf580Q9DB38 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Znf580Q9DB38 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
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Znf580Q9DB38 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Znf580Q9DB38 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Znf580Q9DB38 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Znf580Q9DB38 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Znf580Q9DB38 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Znf580Q9DB38 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Znf580Q9DB38 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Znf580Q9DB38 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Znf580Q9DB38 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Znf580Q9DB38 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Znf580Q9DB38 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Znf580Q9DB38 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Znf580Q9DB38 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Znf580Q9DB38 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Znf580Q9DB38 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Znf580Q9DB38 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Znf580Q9DB38 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Znf580Q9DB38 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Znf580Q9DB38 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Znf580Q9DB38 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Znf580Q9DB38 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Znf580Q9DB38 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Znf580Q9DB38 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Znf580Q9DB38 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Znf580Q9DB38 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Znf580Q9DB38 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Znf580Q9DB38 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Znf580Q9DB38 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
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