Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA47

Tmem239, Transmembrane protein 239, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem239Q9DA47 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem239Q9DA47 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem239Q9DA47 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem239Q9DA47 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem239Q9DA47 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem239Q9DA47 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem239Q9DA47 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem239Q9DA47 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem239Q9DA47 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem239Q9DA47 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem239Q9DA47 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem239Q9DA47 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Tmem239Q9DA47 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem239Q9DA47 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem239Q9DA47 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem239Q9DA47 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem239Q9DA47 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem239Q9DA47 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem239Q9DA47 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem239Q9DA47 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem239Q9DA47 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem239Q9DA47 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem239Q9DA47 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem239Q9DA47 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem239Q9DA47 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem239Q9DA47 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem239Q9DA47 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem239Q9DA47 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem239Q9DA47 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem239Q9DA47 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem239Q9DA47 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem239Q9DA47 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem239Q9DA47 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem239Q9DA47 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem239Q9DA47 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem239Q9DA47 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem239Q9DA47 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem239Q9DA47 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem239Q9DA47 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem239Q9DA47 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem239Q9DA47 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem239Q9DA47 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem239Q9DA47 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem239Q9DA47 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem239Q9DA47 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem239Q9DA47 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem239Q9DA47 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem239Q9DA47 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem239Q9DA47 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem239Q9DA47 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem239Q9DA47 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem239Q9DA47 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem239Q9DA47 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem239Q9DA47 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem239Q9DA47 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem239Q9DA47 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem239Q9DA47 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem239Q9DA47 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Tmem239Q9DA47 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tmem239Q9DA47 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tmem239Q9DA47 Jak1-201ENSMUST00000102781 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tmem239Q9DA47 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tmem239Q9DA47 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tmem239Q9DA47 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tmem239Q9DA47 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tmem239Q9DA47 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tmem239Q9DA47 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tmem239Q9DA47 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tmem239Q9DA47 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tmem239Q9DA47 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tmem239Q9DA47 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tmem239Q9DA47 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tmem239Q9DA47 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Tmem239Q9DA47 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tmem239Q9DA47 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tmem239Q9DA47 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Tmem239Q9DA47 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tmem239Q9DA47 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tmem239Q9DA47 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tmem239Q9DA47 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tmem239Q9DA47 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tmem239Q9DA47 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tmem239Q9DA47 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Tmem239Q9DA47 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tmem239Q9DA47 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tmem239Q9DA47 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tmem239Q9DA47 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tmem239Q9DA47 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tmem239Q9DA47 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tmem239Q9DA47 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tmem239Q9DA47 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tmem239Q9DA47 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tmem239Q9DA47 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tmem239Q9DA47 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tmem239Q9DA47 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tmem239Q9DA47 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Tmem239Q9DA47 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tmem239Q9DA47 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tmem239Q9DA47 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tmem239Q9DA47 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms