Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U8

Snx5, Sorting nexin-5, mousemouse

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Length 404 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx5Q9D8U8 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Snx5Q9D8U8 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Snx5Q9D8U8 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Snx5Q9D8U8 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Snx5Q9D8U8 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Snx5Q9D8U8 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Snx5Q9D8U8 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Snx5Q9D8U8 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Snx5Q9D8U8 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Snx5Q9D8U8 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Snx5Q9D8U8 Riok1-201ENSMUST00000021866 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Snx5Q9D8U8 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Snx5Q9D8U8 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Snx5Q9D8U8 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Snx5Q9D8U8 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Snx5Q9D8U8 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Snx5Q9D8U8 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Snx5Q9D8U8 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Snx5Q9D8U8 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Snx5Q9D8U8 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Snx5Q9D8U8 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Snx5Q9D8U8 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Snx5Q9D8U8 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Snx5Q9D8U8 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Snx5Q9D8U8 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Snx5Q9D8U8 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Snx5Q9D8U8 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Snx5Q9D8U8 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Snx5Q9D8U8 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Snx5Q9D8U8 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Snx5Q9D8U8 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Snx5Q9D8U8 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Snx5Q9D8U8 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Snx5Q9D8U8 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Snx5Q9D8U8 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Snx5Q9D8U8 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Snx5Q9D8U8 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Snx5Q9D8U8 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Snx5Q9D8U8 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Snx5Q9D8U8 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Snx5Q9D8U8 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Snx5Q9D8U8 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Snx5Q9D8U8 Gm43075-201ENSMUST00000198613 3905 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Snx5Q9D8U8 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Snx5Q9D8U8 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Snx5Q9D8U8 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Snx5Q9D8U8 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Snx5Q9D8U8 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Snx5Q9D8U8 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Snx5Q9D8U8 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Snx5Q9D8U8 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Snx5Q9D8U8 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Snx5Q9D8U8 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Snx5Q9D8U8 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Snx5Q9D8U8 Aff3-203ENSMUST00000095027 5857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Snx5Q9D8U8 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Snx5Q9D8U8 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Snx5Q9D8U8 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Snx5Q9D8U8 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Snx5Q9D8U8 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Snx5Q9D8U8 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Snx5Q9D8U8 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Snx5Q9D8U8 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Snx5Q9D8U8 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
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Snx5Q9D8U8 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
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Snx5Q9D8U8 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Snx5Q9D8U8 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Snx5Q9D8U8 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Snx5Q9D8U8 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Snx5Q9D8U8 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Snx5Q9D8U8 Bod1l-204ENSMUST00000202908 10399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Snx5Q9D8U8 Chd5-201ENSMUST00000005175 9122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Snx5Q9D8U8 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Snx5Q9D8U8 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Snx5Q9D8U8 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Snx5Q9D8U8 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Snx5Q9D8U8 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Snx5Q9D8U8 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Snx5Q9D8U8 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Snx5Q9D8U8 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Snx5Q9D8U8 Zfp429-202ENSMUST00000181071 2117 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Snx5Q9D8U8 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Snx5Q9D8U8 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Snx5Q9D8U8 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Snx5Q9D8U8 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Snx5Q9D8U8 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Snx5Q9D8U8 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Snx5Q9D8U8 Zbtb2-202ENSMUST00000100078 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Snx5Q9D8U8 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Snx5Q9D8U8 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Snx5Q9D8U8 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Snx5Q9D8U8 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Snx5Q9D8U8 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Snx5Q9D8U8 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Snx5Q9D8U8 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Snx5Q9D8U8 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
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