Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7J9

Echdc3, Enoyl-CoA hydratase domain-containing protein 3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Echdc3Q9D7J9 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Echdc3Q9D7J9 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Echdc3Q9D7J9 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Echdc3Q9D7J9 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Echdc3Q9D7J9 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Echdc3Q9D7J9 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Echdc3Q9D7J9 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Echdc3Q9D7J9 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Echdc3Q9D7J9 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Echdc3Q9D7J9 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Echdc3Q9D7J9 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Echdc3Q9D7J9 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Echdc3Q9D7J9 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Echdc3Q9D7J9 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Echdc3Q9D7J9 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Echdc3Q9D7J9 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Echdc3Q9D7J9 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Echdc3Q9D7J9 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Echdc3Q9D7J9 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Echdc3Q9D7J9 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Echdc3Q9D7J9 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Echdc3Q9D7J9 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Echdc3Q9D7J9 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Echdc3Q9D7J9 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Echdc3Q9D7J9 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Echdc3Q9D7J9 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Echdc3Q9D7J9 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Echdc3Q9D7J9 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Echdc3Q9D7J9 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Echdc3Q9D7J9 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Echdc3Q9D7J9 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Echdc3Q9D7J9 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Echdc3Q9D7J9 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Echdc3Q9D7J9 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Echdc3Q9D7J9 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Echdc3Q9D7J9 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Echdc3Q9D7J9 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Echdc3Q9D7J9 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Echdc3Q9D7J9 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Echdc3Q9D7J9 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Echdc3Q9D7J9 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Echdc3Q9D7J9 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Echdc3Q9D7J9 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Echdc3Q9D7J9 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Echdc3Q9D7J9 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Echdc3Q9D7J9 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Echdc3Q9D7J9 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Echdc3Q9D7J9 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Echdc3Q9D7J9 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Echdc3Q9D7J9 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Echdc3Q9D7J9 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Echdc3Q9D7J9 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Echdc3Q9D7J9 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Echdc3Q9D7J9 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Echdc3Q9D7J9 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Echdc3Q9D7J9 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Echdc3Q9D7J9 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Echdc3Q9D7J9 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Echdc3Q9D7J9 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Echdc3Q9D7J9 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Echdc3Q9D7J9 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Echdc3Q9D7J9 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Echdc3Q9D7J9 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Echdc3Q9D7J9 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Echdc3Q9D7J9 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Echdc3Q9D7J9 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Echdc3Q9D7J9 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Echdc3Q9D7J9 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Echdc3Q9D7J9 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Echdc3Q9D7J9 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Echdc3Q9D7J9 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Echdc3Q9D7J9 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Echdc3Q9D7J9 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Echdc3Q9D7J9 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Echdc3Q9D7J9 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Echdc3Q9D7J9 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Echdc3Q9D7J9 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Echdc3Q9D7J9 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Echdc3Q9D7J9 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Echdc3Q9D7J9 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Echdc3Q9D7J9 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Echdc3Q9D7J9 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Echdc3Q9D7J9 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Echdc3Q9D7J9 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Echdc3Q9D7J9 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Echdc3Q9D7J9 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Echdc3Q9D7J9 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Echdc3Q9D7J9 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Echdc3Q9D7J9 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Echdc3Q9D7J9 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Echdc3Q9D7J9 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Echdc3Q9D7J9 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Echdc3Q9D7J9 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Echdc3Q9D7J9 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Echdc3Q9D7J9 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Echdc3Q9D7J9 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Echdc3Q9D7J9 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Echdc3Q9D7J9 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Echdc3Q9D7J9 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Echdc3Q9D7J9 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.6 ms