Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y7

Msra, Mitochondrial peptide methionine sulfoxide reductase, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsraQ9D6Y7 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MsraQ9D6Y7 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MsraQ9D6Y7 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MsraQ9D6Y7 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MsraQ9D6Y7 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MsraQ9D6Y7 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MsraQ9D6Y7 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MsraQ9D6Y7 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MsraQ9D6Y7 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
MsraQ9D6Y7 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MsraQ9D6Y7 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MsraQ9D6Y7 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MsraQ9D6Y7 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MsraQ9D6Y7 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
MsraQ9D6Y7 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
MsraQ9D6Y7 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MsraQ9D6Y7 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MsraQ9D6Y7 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MsraQ9D6Y7 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MsraQ9D6Y7 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MsraQ9D6Y7 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MsraQ9D6Y7 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MsraQ9D6Y7 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MsraQ9D6Y7 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MsraQ9D6Y7 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MsraQ9D6Y7 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MsraQ9D6Y7 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MsraQ9D6Y7 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MsraQ9D6Y7 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MsraQ9D6Y7 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MsraQ9D6Y7 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MsraQ9D6Y7 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
MsraQ9D6Y7 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MsraQ9D6Y7 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
MsraQ9D6Y7 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MsraQ9D6Y7 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MsraQ9D6Y7 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
MsraQ9D6Y7 Dusp13-211ENSMUST00000183943 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MsraQ9D6Y7 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MsraQ9D6Y7 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
MsraQ9D6Y7 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MsraQ9D6Y7 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MsraQ9D6Y7 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
MsraQ9D6Y7 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MsraQ9D6Y7 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MsraQ9D6Y7 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MsraQ9D6Y7 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MsraQ9D6Y7 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MsraQ9D6Y7 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MsraQ9D6Y7 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MsraQ9D6Y7 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
MsraQ9D6Y7 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
MsraQ9D6Y7 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MsraQ9D6Y7 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MsraQ9D6Y7 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MsraQ9D6Y7 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MsraQ9D6Y7 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MsraQ9D6Y7 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MsraQ9D6Y7 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MsraQ9D6Y7 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MsraQ9D6Y7 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MsraQ9D6Y7 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MsraQ9D6Y7 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MsraQ9D6Y7 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MsraQ9D6Y7 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MsraQ9D6Y7 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MsraQ9D6Y7 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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MsraQ9D6Y7 S100a14-201ENSMUST00000164481 915 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MsraQ9D6Y7 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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MsraQ9D6Y7 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MsraQ9D6Y7 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
MsraQ9D6Y7 Mir6958-201ENSMUST00000184207 73 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
MsraQ9D6Y7 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
MsraQ9D6Y7 9230114K14Rik-203ENSMUST00000199547 437 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MsraQ9D6Y7 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MsraQ9D6Y7 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
MsraQ9D6Y7 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MsraQ9D6Y7 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
MsraQ9D6Y7 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
MsraQ9D6Y7 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MsraQ9D6Y7 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MsraQ9D6Y7 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MsraQ9D6Y7 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
MsraQ9D6Y7 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MsraQ9D6Y7 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MsraQ9D6Y7 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MsraQ9D6Y7 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MsraQ9D6Y7 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MsraQ9D6Y7 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MsraQ9D6Y7 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MsraQ9D6Y7 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MsraQ9D6Y7 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MsraQ9D6Y7 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MsraQ9D6Y7 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MsraQ9D6Y7 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
MsraQ9D6Y7 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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