Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J3

Ccdc94, Coiled-coil domain-containing protein 94, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc94Q9D6J3 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc94Q9D6J3 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc94Q9D6J3 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc94Q9D6J3 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc94Q9D6J3 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc94Q9D6J3 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc94Q9D6J3 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc94Q9D6J3 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc94Q9D6J3 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc94Q9D6J3 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc94Q9D6J3 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc94Q9D6J3 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc94Q9D6J3 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc94Q9D6J3 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc94Q9D6J3 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc94Q9D6J3 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc94Q9D6J3 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc94Q9D6J3 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc94Q9D6J3 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc94Q9D6J3 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc94Q9D6J3 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc94Q9D6J3 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc94Q9D6J3 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc94Q9D6J3 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc94Q9D6J3 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc94Q9D6J3 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc94Q9D6J3 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ccdc94Q9D6J3 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc94Q9D6J3 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc94Q9D6J3 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc94Q9D6J3 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc94Q9D6J3 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc94Q9D6J3 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc94Q9D6J3 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc94Q9D6J3 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc94Q9D6J3 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc94Q9D6J3 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc94Q9D6J3 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc94Q9D6J3 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc94Q9D6J3 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc94Q9D6J3 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc94Q9D6J3 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc94Q9D6J3 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc94Q9D6J3 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc94Q9D6J3 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc94Q9D6J3 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc94Q9D6J3 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc94Q9D6J3 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc94Q9D6J3 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc94Q9D6J3 BC003331-203ENSMUST00000097546 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc94Q9D6J3 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc94Q9D6J3 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc94Q9D6J3 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc94Q9D6J3 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc94Q9D6J3 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc94Q9D6J3 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc94Q9D6J3 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc94Q9D6J3 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc94Q9D6J3 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc94Q9D6J3 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc94Q9D6J3 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc94Q9D6J3 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc94Q9D6J3 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc94Q9D6J3 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ccdc94Q9D6J3 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc94Q9D6J3 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc94Q9D6J3 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc94Q9D6J3 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc94Q9D6J3 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc94Q9D6J3 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc94Q9D6J3 Tfe3-205ENSMUST00000115678 2658 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc94Q9D6J3 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc94Q9D6J3 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc94Q9D6J3 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc94Q9D6J3 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc94Q9D6J3 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc94Q9D6J3 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc94Q9D6J3 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc94Q9D6J3 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc94Q9D6J3 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc94Q9D6J3 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc94Q9D6J3 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc94Q9D6J3 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc94Q9D6J3 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc94Q9D6J3 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc94Q9D6J3 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc94Q9D6J3 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc94Q9D6J3 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc94Q9D6J3 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc94Q9D6J3 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc94Q9D6J3 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc94Q9D6J3 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc94Q9D6J3 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc94Q9D6J3 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc94Q9D6J3 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc94Q9D6J3 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc94Q9D6J3 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ccdc94Q9D6J3 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc94Q9D6J3 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccdc94Q9D6J3 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.5 ms