Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6I3

Pfn4, Profilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfn4Q9D6I3 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pfn4Q9D6I3 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pfn4Q9D6I3 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pfn4Q9D6I3 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pfn4Q9D6I3 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pfn4Q9D6I3 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pfn4Q9D6I3 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Pfn4Q9D6I3 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pfn4Q9D6I3 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pfn4Q9D6I3 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pfn4Q9D6I3 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pfn4Q9D6I3 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Pfn4Q9D6I3 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Pfn4Q9D6I3 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pfn4Q9D6I3 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pfn4Q9D6I3 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Pfn4Q9D6I3 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pfn4Q9D6I3 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Pfn4Q9D6I3 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pfn4Q9D6I3 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pfn4Q9D6I3 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pfn4Q9D6I3 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pfn4Q9D6I3 Zc3h4-202ENSMUST00000209289 5853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pfn4Q9D6I3 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pfn4Q9D6I3 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pfn4Q9D6I3 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pfn4Q9D6I3 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pfn4Q9D6I3 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pfn4Q9D6I3 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pfn4Q9D6I3 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pfn4Q9D6I3 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pfn4Q9D6I3 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pfn4Q9D6I3 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pfn4Q9D6I3 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pfn4Q9D6I3 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pfn4Q9D6I3 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pfn4Q9D6I3 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pfn4Q9D6I3 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pfn4Q9D6I3 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pfn4Q9D6I3 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pfn4Q9D6I3 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pfn4Q9D6I3 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pfn4Q9D6I3 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pfn4Q9D6I3 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pfn4Q9D6I3 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pfn4Q9D6I3 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pfn4Q9D6I3 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pfn4Q9D6I3 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Pfn4Q9D6I3 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pfn4Q9D6I3 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pfn4Q9D6I3 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pfn4Q9D6I3 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Pfn4Q9D6I3 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Pfn4Q9D6I3 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pfn4Q9D6I3 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Pfn4Q9D6I3 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pfn4Q9D6I3 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Pfn4Q9D6I3 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Pfn4Q9D6I3 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pfn4Q9D6I3 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pfn4Q9D6I3 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pfn4Q9D6I3 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pfn4Q9D6I3 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pfn4Q9D6I3 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pfn4Q9D6I3 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pfn4Q9D6I3 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pfn4Q9D6I3 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pfn4Q9D6I3 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pfn4Q9D6I3 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pfn4Q9D6I3 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Pfn4Q9D6I3 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pfn4Q9D6I3 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Pfn4Q9D6I3 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Pfn4Q9D6I3 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Pfn4Q9D6I3 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Pfn4Q9D6I3 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pfn4Q9D6I3 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pfn4Q9D6I3 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pfn4Q9D6I3 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pfn4Q9D6I3 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pfn4Q9D6I3 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pfn4Q9D6I3 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pfn4Q9D6I3 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pfn4Q9D6I3 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pfn4Q9D6I3 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pfn4Q9D6I3 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pfn4Q9D6I3 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pfn4Q9D6I3 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pfn4Q9D6I3 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pfn4Q9D6I3 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pfn4Q9D6I3 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pfn4Q9D6I3 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pfn4Q9D6I3 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pfn4Q9D6I3 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pfn4Q9D6I3 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pfn4Q9D6I3 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pfn4Q9D6I3 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pfn4Q9D6I3 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pfn4Q9D6I3 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Pfn4Q9D6I3 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms