Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4E6

Pabpc6, Polyadenylate-binding protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 643 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc6Q9D4E6 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Pabpc6Q9D4E6 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pabpc6Q9D4E6 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pabpc6Q9D4E6 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pabpc6Q9D4E6 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pabpc6Q9D4E6 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pabpc6Q9D4E6 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pabpc6Q9D4E6 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pabpc6Q9D4E6 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pabpc6Q9D4E6 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pabpc6Q9D4E6 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pabpc6Q9D4E6 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pabpc6Q9D4E6 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pabpc6Q9D4E6 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Pabpc6Q9D4E6 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pabpc6Q9D4E6 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pabpc6Q9D4E6 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pabpc6Q9D4E6 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pabpc6Q9D4E6 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pabpc6Q9D4E6 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pabpc6Q9D4E6 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pabpc6Q9D4E6 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pabpc6Q9D4E6 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Pabpc6Q9D4E6 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pabpc6Q9D4E6 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pabpc6Q9D4E6 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pabpc6Q9D4E6 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Pabpc6Q9D4E6 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Pabpc6Q9D4E6 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pabpc6Q9D4E6 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pabpc6Q9D4E6 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Pabpc6Q9D4E6 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pabpc6Q9D4E6 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pabpc6Q9D4E6 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pabpc6Q9D4E6 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pabpc6Q9D4E6 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pabpc6Q9D4E6 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pabpc6Q9D4E6 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pabpc6Q9D4E6 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pabpc6Q9D4E6 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pabpc6Q9D4E6 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pabpc6Q9D4E6 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pabpc6Q9D4E6 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pabpc6Q9D4E6 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pabpc6Q9D4E6 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pabpc6Q9D4E6 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pabpc6Q9D4E6 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pabpc6Q9D4E6 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Pabpc6Q9D4E6 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pabpc6Q9D4E6 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pabpc6Q9D4E6 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pabpc6Q9D4E6 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pabpc6Q9D4E6 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pabpc6Q9D4E6 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pabpc6Q9D4E6 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pabpc6Q9D4E6 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pabpc6Q9D4E6 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pabpc6Q9D4E6 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Pabpc6Q9D4E6 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pabpc6Q9D4E6 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pabpc6Q9D4E6 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pabpc6Q9D4E6 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pabpc6Q9D4E6 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pabpc6Q9D4E6 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pabpc6Q9D4E6 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pabpc6Q9D4E6 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pabpc6Q9D4E6 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Pabpc6Q9D4E6 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Pabpc6Q9D4E6 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Pabpc6Q9D4E6 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pabpc6Q9D4E6 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pabpc6Q9D4E6 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pabpc6Q9D4E6 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pabpc6Q9D4E6 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Pabpc6Q9D4E6 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pabpc6Q9D4E6 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pabpc6Q9D4E6 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pabpc6Q9D4E6 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pabpc6Q9D4E6 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pabpc6Q9D4E6 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pabpc6Q9D4E6 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pabpc6Q9D4E6 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pabpc6Q9D4E6 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pabpc6Q9D4E6 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pabpc6Q9D4E6 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pabpc6Q9D4E6 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pabpc6Q9D4E6 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pabpc6Q9D4E6 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pabpc6Q9D4E6 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pabpc6Q9D4E6 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pabpc6Q9D4E6 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pabpc6Q9D4E6 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pabpc6Q9D4E6 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pabpc6Q9D4E6 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pabpc6Q9D4E6 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
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