Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3E6

Stag1, Cohesin subunit SA-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stag1Q9D3E6 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stag1Q9D3E6 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stag1Q9D3E6 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stag1Q9D3E6 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stag1Q9D3E6 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stag1Q9D3E6 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stag1Q9D3E6 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stag1Q9D3E6 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stag1Q9D3E6 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stag1Q9D3E6 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stag1Q9D3E6 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stag1Q9D3E6 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stag1Q9D3E6 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stag1Q9D3E6 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stag1Q9D3E6 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Stag1Q9D3E6 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stag1Q9D3E6 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stag1Q9D3E6 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stag1Q9D3E6 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stag1Q9D3E6 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Stag1Q9D3E6 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stag1Q9D3E6 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stag1Q9D3E6 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stag1Q9D3E6 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stag1Q9D3E6 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stag1Q9D3E6 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stag1Q9D3E6 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stag1Q9D3E6 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stag1Q9D3E6 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stag1Q9D3E6 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stag1Q9D3E6 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stag1Q9D3E6 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stag1Q9D3E6 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stag1Q9D3E6 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stag1Q9D3E6 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stag1Q9D3E6 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Stag1Q9D3E6 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Stag1Q9D3E6 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stag1Q9D3E6 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stag1Q9D3E6 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stag1Q9D3E6 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stag1Q9D3E6 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stag1Q9D3E6 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Stag1Q9D3E6 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Stag1Q9D3E6 AC139319.1-201ENSMUST00000223331 690 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stag1Q9D3E6 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Stag1Q9D3E6 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Stag1Q9D3E6 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stag1Q9D3E6 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stag1Q9D3E6 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stag1Q9D3E6 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stag1Q9D3E6 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stag1Q9D3E6 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stag1Q9D3E6 Gemin2-201ENSMUST00000021379 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stag1Q9D3E6 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stag1Q9D3E6 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stag1Q9D3E6 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stag1Q9D3E6 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stag1Q9D3E6 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Stag1Q9D3E6 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Stag1Q9D3E6 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Stag1Q9D3E6 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Stag1Q9D3E6 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Stag1Q9D3E6 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Stag1Q9D3E6 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Stag1Q9D3E6 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Stag1Q9D3E6 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Stag1Q9D3E6 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Stag1Q9D3E6 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Stag1Q9D3E6 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Stag1Q9D3E6 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Stag1Q9D3E6 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Stag1Q9D3E6 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Stag1Q9D3E6 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Stag1Q9D3E6 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Stag1Q9D3E6 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Stag1Q9D3E6 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Stag1Q9D3E6 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Stag1Q9D3E6 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Stag1Q9D3E6 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Stag1Q9D3E6 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Stag1Q9D3E6 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Stag1Q9D3E6 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Stag1Q9D3E6 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Stag1Q9D3E6 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Stag1Q9D3E6 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Stag1Q9D3E6 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Stag1Q9D3E6 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Stag1Q9D3E6 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Stag1Q9D3E6 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Stag1Q9D3E6 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Stag1Q9D3E6 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Stag1Q9D3E6 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Stag1Q9D3E6 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Stag1Q9D3E6 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Stag1Q9D3E6 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Stag1Q9D3E6 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Stag1Q9D3E6 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Stag1Q9D3E6 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Stag1Q9D3E6 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms