Protein–RNA interactions for Protein: Q9D394

Rufy3, Protein RUFY3, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy3Q9D394 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rufy3Q9D394 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rufy3Q9D394 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rufy3Q9D394 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rufy3Q9D394 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rufy3Q9D394 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rufy3Q9D394 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rufy3Q9D394 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rufy3Q9D394 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rufy3Q9D394 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rufy3Q9D394 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rufy3Q9D394 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rufy3Q9D394 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rufy3Q9D394 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rufy3Q9D394 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rufy3Q9D394 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rufy3Q9D394 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rufy3Q9D394 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rufy3Q9D394 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rufy3Q9D394 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Rufy3Q9D394 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Rufy3Q9D394 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rufy3Q9D394 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rufy3Q9D394 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rufy3Q9D394 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rufy3Q9D394 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rufy3Q9D394 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rufy3Q9D394 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rufy3Q9D394 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rufy3Q9D394 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rufy3Q9D394 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rufy3Q9D394 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rufy3Q9D394 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rufy3Q9D394 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rufy3Q9D394 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rufy3Q9D394 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rufy3Q9D394 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rufy3Q9D394 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rufy3Q9D394 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rufy3Q9D394 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rufy3Q9D394 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rufy3Q9D394 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rufy3Q9D394 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rufy3Q9D394 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rufy3Q9D394 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rufy3Q9D394 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rufy3Q9D394 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rufy3Q9D394 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rufy3Q9D394 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rufy3Q9D394 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rufy3Q9D394 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rufy3Q9D394 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rufy3Q9D394 7420426K07Rik-201ENSMUST00000098460 1504 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rufy3Q9D394 Fbxl5-211ENSMUST00000196483 2814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rufy3Q9D394 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rufy3Q9D394 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rufy3Q9D394 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rufy3Q9D394 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rufy3Q9D394 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rufy3Q9D394 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rufy3Q9D394 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rufy3Q9D394 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rufy3Q9D394 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rufy3Q9D394 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rufy3Q9D394 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rufy3Q9D394 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rufy3Q9D394 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rufy3Q9D394 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rufy3Q9D394 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rufy3Q9D394 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rufy3Q9D394 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rufy3Q9D394 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rufy3Q9D394 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rufy3Q9D394 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rufy3Q9D394 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rufy3Q9D394 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rufy3Q9D394 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rufy3Q9D394 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rufy3Q9D394 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rufy3Q9D394 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rufy3Q9D394 Max-201ENSMUST00000082136 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rufy3Q9D394 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rufy3Q9D394 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rufy3Q9D394 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rufy3Q9D394 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rufy3Q9D394 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rufy3Q9D394 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rufy3Q9D394 Ctbp2-209ENSMUST00000166439 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rufy3Q9D394 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rufy3Q9D394 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rufy3Q9D394 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rufy3Q9D394 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rufy3Q9D394 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rufy3Q9D394 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rufy3Q9D394 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rufy3Q9D394 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rufy3Q9D394 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rufy3Q9D394 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rufy3Q9D394 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rufy3Q9D394 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms