Protein–RNA interactions for Protein: Q9D312

Krt20, Keratin, type I cytoskeletal 20, mousemouse

Predictions only

Length 431 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt20Q9D312 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 Alpk3-201ENSMUST00000107348 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Krt20Q9D312 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms