Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 Ttll12-201ENSMUST00000016901 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 Hps3-201ENSMUST00000012580 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 Acot7-202ENSMUST00000075363 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 Flywch1-201ENSMUST00000045517 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Syf2Q9D198 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms