Protein–RNA interactions for Protein: Q9D136

Ogfod3, 2-oxoglutarate and iron-dependent oxygenase domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 315 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ogfod3Q9D136 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
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Ogfod3Q9D136 Gm28745-201ENSMUST00000190069 305 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
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Ogfod3Q9D136 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ogfod3Q9D136 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Ogfod3Q9D136 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ogfod3Q9D136 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Ogfod3Q9D136 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ogfod3Q9D136 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
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Ogfod3Q9D136 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ogfod3Q9D136 1700110I01Rik-201ENSMUST00000112775 1671 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ogfod3Q9D136 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ogfod3Q9D136 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ogfod3Q9D136 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Ogfod3Q9D136 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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