Protein–RNA interactions for Protein: Q9D114

Hddc3, Guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase MESH1, mousemouse

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Length 179 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc3Q9D114 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Hddc3Q9D114 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hddc3Q9D114 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hddc3Q9D114 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Hddc3Q9D114 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Hddc3Q9D114 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hddc3Q9D114 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hddc3Q9D114 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Hddc3Q9D114 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Hddc3Q9D114 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hddc3Q9D114 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hddc3Q9D114 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Hddc3Q9D114 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hddc3Q9D114 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hddc3Q9D114 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hddc3Q9D114 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hddc3Q9D114 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hddc3Q9D114 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Hddc3Q9D114 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hddc3Q9D114 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hddc3Q9D114 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Hddc3Q9D114 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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Hddc3Q9D114 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Hddc3Q9D114 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Hddc3Q9D114 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hddc3Q9D114 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hddc3Q9D114 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Hddc3Q9D114 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hddc3Q9D114 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Hddc3Q9D114 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hddc3Q9D114 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Hddc3Q9D114 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Hddc3Q9D114 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hddc3Q9D114 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hddc3Q9D114 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Hddc3Q9D114 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hddc3Q9D114 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hddc3Q9D114 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hddc3Q9D114 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Hddc3Q9D114 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Hddc3Q9D114 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hddc3Q9D114 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hddc3Q9D114 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hddc3Q9D114 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hddc3Q9D114 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hddc3Q9D114 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hddc3Q9D114 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hddc3Q9D114 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Hddc3Q9D114 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hddc3Q9D114 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hddc3Q9D114 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hddc3Q9D114 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Hddc3Q9D114 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hddc3Q9D114 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hddc3Q9D114 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hddc3Q9D114 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hddc3Q9D114 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Hddc3Q9D114 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hddc3Q9D114 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hddc3Q9D114 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hddc3Q9D114 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hddc3Q9D114 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hddc3Q9D114 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hddc3Q9D114 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hddc3Q9D114 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hddc3Q9D114 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hddc3Q9D114 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hddc3Q9D114 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hddc3Q9D114 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hddc3Q9D114 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Hddc3Q9D114 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Hddc3Q9D114 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hddc3Q9D114 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hddc3Q9D114 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hddc3Q9D114 Fkbp7-201ENSMUST00000002809 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hddc3Q9D114 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Hddc3Q9D114 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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