Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0N8

Tmem88, Transmembrane protein 88, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem88Q9D0N8 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem88Q9D0N8 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem88Q9D0N8 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem88Q9D0N8 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem88Q9D0N8 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem88Q9D0N8 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem88Q9D0N8 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem88Q9D0N8 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem88Q9D0N8 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem88Q9D0N8 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem88Q9D0N8 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem88Q9D0N8 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem88Q9D0N8 Nfatc2-209ENSMUST00000171689 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem88Q9D0N8 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem88Q9D0N8 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem88Q9D0N8 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem88Q9D0N8 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem88Q9D0N8 Plpbp-205ENSMUST00000209856 3954 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem88Q9D0N8 Hgs-203ENSMUST00000106205 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem88Q9D0N8 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem88Q9D0N8 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem88Q9D0N8 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem88Q9D0N8 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem88Q9D0N8 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem88Q9D0N8 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem88Q9D0N8 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem88Q9D0N8 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem88Q9D0N8 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem88Q9D0N8 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Tmem88Q9D0N8 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tmem88Q9D0N8 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tmem88Q9D0N8 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tmem88Q9D0N8 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tmem88Q9D0N8 Gm5124-202ENSMUST00000132683 2083 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Tmem88Q9D0N8 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tmem88Q9D0N8 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tmem88Q9D0N8 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tmem88Q9D0N8 Adcy8-201ENSMUST00000023007 6990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tmem88Q9D0N8 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tmem88Q9D0N8 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tmem88Q9D0N8 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tmem88Q9D0N8 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tmem88Q9D0N8 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tmem88Q9D0N8 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tmem88Q9D0N8 AC122840.1-201ENSMUST00000220915 3334 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Tmem88Q9D0N8 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tmem88Q9D0N8 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tmem88Q9D0N8 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tmem88Q9D0N8 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tmem88Q9D0N8 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tmem88Q9D0N8 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tmem88Q9D0N8 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Tmem88Q9D0N8 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tmem88Q9D0N8 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tmem88Q9D0N8 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tmem88Q9D0N8 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tmem88Q9D0N8 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tmem88Q9D0N8 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Tmem88Q9D0N8 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tmem88Q9D0N8 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tmem88Q9D0N8 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tmem88Q9D0N8 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tmem88Q9D0N8 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tmem88Q9D0N8 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tmem88Q9D0N8 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tmem88Q9D0N8 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tmem88Q9D0N8 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tmem88Q9D0N8 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tmem88Q9D0N8 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tmem88Q9D0N8 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tmem88Q9D0N8 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tmem88Q9D0N8 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tmem88Q9D0N8 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tmem88Q9D0N8 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tmem88Q9D0N8 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tmem88Q9D0N8 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC10.46□□□□□ -0.74
Tmem88Q9D0N8 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tmem88Q9D0N8 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tmem88Q9D0N8 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tmem88Q9D0N8 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Tmem88Q9D0N8 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem88Q9D0N8 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem88Q9D0N8 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem88Q9D0N8 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem88Q9D0N8 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem88Q9D0N8 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem88Q9D0N8 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem88Q9D0N8 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem88Q9D0N8 Prrt3-204ENSMUST00000205075 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem88Q9D0N8 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem88Q9D0N8 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem88Q9D0N8 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem88Q9D0N8 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem88Q9D0N8 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem88Q9D0N8 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem88Q9D0N8 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem88Q9D0N8 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem88Q9D0N8 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem88Q9D0N8 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Tmem88Q9D0N8 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
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