Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc47Q9D024 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc47Q9D024 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc47Q9D024 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc47Q9D024 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc47Q9D024 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc47Q9D024 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc47Q9D024 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc47Q9D024 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc47Q9D024 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc47Q9D024 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc47Q9D024 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc47Q9D024 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc47Q9D024 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc47Q9D024 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc47Q9D024 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc47Q9D024 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc47Q9D024 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc47Q9D024 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc47Q9D024 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc47Q9D024 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc47Q9D024 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc47Q9D024 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc47Q9D024 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc47Q9D024 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc47Q9D024 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc47Q9D024 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc47Q9D024 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc47Q9D024 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc47Q9D024 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc47Q9D024 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc47Q9D024 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc47Q9D024 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc47Q9D024 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc47Q9D024 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc47Q9D024 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc47Q9D024 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc47Q9D024 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc47Q9D024 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc47Q9D024 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc47Q9D024 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc47Q9D024 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc47Q9D024 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc47Q9D024 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc47Q9D024 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc47Q9D024 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc47Q9D024 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc47Q9D024 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc47Q9D024 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc47Q9D024 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc47Q9D024 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc47Q9D024 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc47Q9D024 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc47Q9D024 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc47Q9D024 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc47Q9D024 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc47Q9D024 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc47Q9D024 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc47Q9D024 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc47Q9D024 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc47Q9D024 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc47Q9D024 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc47Q9D024 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc47Q9D024 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc47Q9D024 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc47Q9D024 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc47Q9D024 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc47Q9D024 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc47Q9D024 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc47Q9D024 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc47Q9D024 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc47Q9D024 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc47Q9D024 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc47Q9D024 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc47Q9D024 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc47Q9D024 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc47Q9D024 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc47Q9D024 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc47Q9D024 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc47Q9D024 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc47Q9D024 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc47Q9D024 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc47Q9D024 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccdc47Q9D024 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc47Q9D024 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc47Q9D024 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc47Q9D024 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc47Q9D024 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc47Q9D024 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc47Q9D024 AC096628.2-201ENSMUST00000225443 1413 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc47Q9D024 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc47Q9D024 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc47Q9D024 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc47Q9D024 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc47Q9D024 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc47Q9D024 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc47Q9D024 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc47Q9D024 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc47Q9D024 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc47Q9D024 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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