Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYH6

Rrs1, Ribosome biogenesis regulatory protein homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrs1Q9CYH6 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rrs1Q9CYH6 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rrs1Q9CYH6 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rrs1Q9CYH6 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rrs1Q9CYH6 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rrs1Q9CYH6 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rrs1Q9CYH6 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rrs1Q9CYH6 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rrs1Q9CYH6 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rrs1Q9CYH6 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rrs1Q9CYH6 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rrs1Q9CYH6 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rrs1Q9CYH6 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rrs1Q9CYH6 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rrs1Q9CYH6 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rrs1Q9CYH6 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rrs1Q9CYH6 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rrs1Q9CYH6 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rrs1Q9CYH6 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rrs1Q9CYH6 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rrs1Q9CYH6 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Rrs1Q9CYH6 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rrs1Q9CYH6 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rrs1Q9CYH6 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rrs1Q9CYH6 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rrs1Q9CYH6 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rrs1Q9CYH6 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rrs1Q9CYH6 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rrs1Q9CYH6 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rrs1Q9CYH6 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rrs1Q9CYH6 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rrs1Q9CYH6 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rrs1Q9CYH6 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rrs1Q9CYH6 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rrs1Q9CYH6 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rrs1Q9CYH6 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rrs1Q9CYH6 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rrs1Q9CYH6 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rrs1Q9CYH6 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rrs1Q9CYH6 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rrs1Q9CYH6 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rrs1Q9CYH6 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rrs1Q9CYH6 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rrs1Q9CYH6 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rrs1Q9CYH6 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rrs1Q9CYH6 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rrs1Q9CYH6 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rrs1Q9CYH6 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rrs1Q9CYH6 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rrs1Q9CYH6 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rrs1Q9CYH6 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rrs1Q9CYH6 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rrs1Q9CYH6 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rrs1Q9CYH6 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rrs1Q9CYH6 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rrs1Q9CYH6 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rrs1Q9CYH6 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rrs1Q9CYH6 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rrs1Q9CYH6 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rrs1Q9CYH6 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rrs1Q9CYH6 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rrs1Q9CYH6 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rrs1Q9CYH6 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rrs1Q9CYH6 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Rrs1Q9CYH6 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rrs1Q9CYH6 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rrs1Q9CYH6 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rrs1Q9CYH6 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rrs1Q9CYH6 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rrs1Q9CYH6 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rrs1Q9CYH6 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rrs1Q9CYH6 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rrs1Q9CYH6 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rrs1Q9CYH6 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rrs1Q9CYH6 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rrs1Q9CYH6 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rrs1Q9CYH6 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rrs1Q9CYH6 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rrs1Q9CYH6 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rrs1Q9CYH6 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rrs1Q9CYH6 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rrs1Q9CYH6 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rrs1Q9CYH6 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rrs1Q9CYH6 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rrs1Q9CYH6 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rrs1Q9CYH6 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rrs1Q9CYH6 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rrs1Q9CYH6 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rrs1Q9CYH6 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rrs1Q9CYH6 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rrs1Q9CYH6 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rrs1Q9CYH6 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Rrs1Q9CYH6 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rrs1Q9CYH6 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rrs1Q9CYH6 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rrs1Q9CYH6 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rrs1Q9CYH6 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rrs1Q9CYH6 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rrs1Q9CYH6 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rrs1Q9CYH6 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms