Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE6

Xrcc3, DNA repair protein XRCC3, mousemouse

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Length 349 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc3Q9CXE6 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Xrcc3Q9CXE6 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Xrcc3Q9CXE6 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Xrcc3Q9CXE6 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Xrcc3Q9CXE6 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Xrcc3Q9CXE6 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Xrcc3Q9CXE6 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Xrcc3Q9CXE6 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Xrcc3Q9CXE6 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Xrcc3Q9CXE6 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Xrcc3Q9CXE6 Gm8108-202ENSMUST00000170207 1961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Xrcc3Q9CXE6 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Xrcc3Q9CXE6 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Xrcc3Q9CXE6 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Xrcc3Q9CXE6 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Xrcc3Q9CXE6 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Xrcc3Q9CXE6 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Xrcc3Q9CXE6 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Xrcc3Q9CXE6 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Xrcc3Q9CXE6 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Xrcc3Q9CXE6 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Xrcc3Q9CXE6 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Xrcc3Q9CXE6 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Xrcc3Q9CXE6 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Xrcc3Q9CXE6 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Xrcc3Q9CXE6 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Xrcc3Q9CXE6 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Xrcc3Q9CXE6 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Xrcc3Q9CXE6 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Xrcc3Q9CXE6 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Xrcc3Q9CXE6 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Xrcc3Q9CXE6 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Xrcc3Q9CXE6 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Xrcc3Q9CXE6 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Xrcc3Q9CXE6 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Xrcc3Q9CXE6 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Xrcc3Q9CXE6 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Xrcc3Q9CXE6 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
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Xrcc3Q9CXE6 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Xrcc3Q9CXE6 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Xrcc3Q9CXE6 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Xrcc3Q9CXE6 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Xrcc3Q9CXE6 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Xrcc3Q9CXE6 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Xrcc3Q9CXE6 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Xrcc3Q9CXE6 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Xrcc3Q9CXE6 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Xrcc3Q9CXE6 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Xrcc3Q9CXE6 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Xrcc3Q9CXE6 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Xrcc3Q9CXE6 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Xrcc3Q9CXE6 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Xrcc3Q9CXE6 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Xrcc3Q9CXE6 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Xrcc3Q9CXE6 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Xrcc3Q9CXE6 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Xrcc3Q9CXE6 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Xrcc3Q9CXE6 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Xrcc3Q9CXE6 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Xrcc3Q9CXE6 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Xrcc3Q9CXE6 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Xrcc3Q9CXE6 Srms-201ENSMUST00000016498 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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Xrcc3Q9CXE6 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Xrcc3Q9CXE6 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Xrcc3Q9CXE6 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Xrcc3Q9CXE6 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
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Xrcc3Q9CXE6 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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Xrcc3Q9CXE6 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Xrcc3Q9CXE6 Adrb3-201ENSMUST00000081438 2795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Xrcc3Q9CXE6 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Xrcc3Q9CXE6 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
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Xrcc3Q9CXE6 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
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Xrcc3Q9CXE6 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Xrcc3Q9CXE6 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Xrcc3Q9CXE6 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Xrcc3Q9CXE6 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Xrcc3Q9CXE6 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Xrcc3Q9CXE6 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Xrcc3Q9CXE6 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Xrcc3Q9CXE6 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Xrcc3Q9CXE6 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Xrcc3Q9CXE6 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Xrcc3Q9CXE6 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Xrcc3Q9CXE6 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Xrcc3Q9CXE6 Bscl2-210ENSMUST00000171649 1962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Xrcc3Q9CXE6 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Xrcc3Q9CXE6 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Xrcc3Q9CXE6 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Xrcc3Q9CXE6 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Xrcc3Q9CXE6 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Xrcc3Q9CXE6 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
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