Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX11

Utp23, rRNA-processing protein UTP23 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp23Q9CX11 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Utp23Q9CX11 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Utp23Q9CX11 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Utp23Q9CX11 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Utp23Q9CX11 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Utp23Q9CX11 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Utp23Q9CX11 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Utp23Q9CX11 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Utp23Q9CX11 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Utp23Q9CX11 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Utp23Q9CX11 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Utp23Q9CX11 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Utp23Q9CX11 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Utp23Q9CX11 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Utp23Q9CX11 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Utp23Q9CX11 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Utp23Q9CX11 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Utp23Q9CX11 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Utp23Q9CX11 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Utp23Q9CX11 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Utp23Q9CX11 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Utp23Q9CX11 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Utp23Q9CX11 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Utp23Q9CX11 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Utp23Q9CX11 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Utp23Q9CX11 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Utp23Q9CX11 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Utp23Q9CX11 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Utp23Q9CX11 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Utp23Q9CX11 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Utp23Q9CX11 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Utp23Q9CX11 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Utp23Q9CX11 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Utp23Q9CX11 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Utp23Q9CX11 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Utp23Q9CX11 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Utp23Q9CX11 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Utp23Q9CX11 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Utp23Q9CX11 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Utp23Q9CX11 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Utp23Q9CX11 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Utp23Q9CX11 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Utp23Q9CX11 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Utp23Q9CX11 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Utp23Q9CX11 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Utp23Q9CX11 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Utp23Q9CX11 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Utp23Q9CX11 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Utp23Q9CX11 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Utp23Q9CX11 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Utp23Q9CX11 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Utp23Q9CX11 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Utp23Q9CX11 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Utp23Q9CX11 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Utp23Q9CX11 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Utp23Q9CX11 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Utp23Q9CX11 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Utp23Q9CX11 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Utp23Q9CX11 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Utp23Q9CX11 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Utp23Q9CX11 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Utp23Q9CX11 AC159896.2-201ENSMUST00000214753 269 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
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Utp23Q9CX11 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Utp23Q9CX11 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Utp23Q9CX11 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Utp23Q9CX11 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Utp23Q9CX11 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Utp23Q9CX11 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Utp23Q9CX11 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Utp23Q9CX11 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Utp23Q9CX11 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Utp23Q9CX11 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Utp23Q9CX11 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Utp23Q9CX11 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Utp23Q9CX11 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Utp23Q9CX11 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Utp23Q9CX11 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Utp23Q9CX11 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Utp23Q9CX11 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Utp23Q9CX11 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Utp23Q9CX11 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Utp23Q9CX11 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Utp23Q9CX11 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Utp23Q9CX11 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Utp23Q9CX11 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Utp23Q9CX11 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Utp23Q9CX11 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Utp23Q9CX11 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Utp23Q9CX11 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Utp23Q9CX11 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Utp23Q9CX11 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Utp23Q9CX11 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Utp23Q9CX11 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Utp23Q9CX11 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Utp23Q9CX11 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Utp23Q9CX11 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Utp23Q9CX11 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
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