Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWV6

Prkrip1, PRKR-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkrip1Q9CWV6 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prkrip1Q9CWV6 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prkrip1Q9CWV6 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prkrip1Q9CWV6 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prkrip1Q9CWV6 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prkrip1Q9CWV6 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prkrip1Q9CWV6 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prkrip1Q9CWV6 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Prkrip1Q9CWV6 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prkrip1Q9CWV6 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prkrip1Q9CWV6 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prkrip1Q9CWV6 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prkrip1Q9CWV6 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Prkrip1Q9CWV6 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Prkrip1Q9CWV6 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prkrip1Q9CWV6 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prkrip1Q9CWV6 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prkrip1Q9CWV6 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prkrip1Q9CWV6 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prkrip1Q9CWV6 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prkrip1Q9CWV6 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prkrip1Q9CWV6 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prkrip1Q9CWV6 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Prkrip1Q9CWV6 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prkrip1Q9CWV6 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prkrip1Q9CWV6 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Prkrip1Q9CWV6 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prkrip1Q9CWV6 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prkrip1Q9CWV6 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prkrip1Q9CWV6 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prkrip1Q9CWV6 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prkrip1Q9CWV6 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prkrip1Q9CWV6 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prkrip1Q9CWV6 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prkrip1Q9CWV6 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prkrip1Q9CWV6 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prkrip1Q9CWV6 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prkrip1Q9CWV6 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prkrip1Q9CWV6 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prkrip1Q9CWV6 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Prkrip1Q9CWV6 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prkrip1Q9CWV6 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prkrip1Q9CWV6 Dkkl1-204ENSMUST00000210741 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prkrip1Q9CWV6 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prkrip1Q9CWV6 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prkrip1Q9CWV6 Cyb5rl-203ENSMUST00000106758 2516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prkrip1Q9CWV6 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prkrip1Q9CWV6 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prkrip1Q9CWV6 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prkrip1Q9CWV6 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prkrip1Q9CWV6 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Prkrip1Q9CWV6 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Prkrip1Q9CWV6 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prkrip1Q9CWV6 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prkrip1Q9CWV6 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prkrip1Q9CWV6 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prkrip1Q9CWV6 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prkrip1Q9CWV6 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prkrip1Q9CWV6 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prkrip1Q9CWV6 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Prkrip1Q9CWV6 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Prkrip1Q9CWV6 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prkrip1Q9CWV6 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prkrip1Q9CWV6 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Prkrip1Q9CWV6 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prkrip1Q9CWV6 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Prkrip1Q9CWV6 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Prkrip1Q9CWV6 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prkrip1Q9CWV6 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prkrip1Q9CWV6 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Prkrip1Q9CWV6 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prkrip1Q9CWV6 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prkrip1Q9CWV6 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prkrip1Q9CWV6 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prkrip1Q9CWV6 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prkrip1Q9CWV6 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prkrip1Q9CWV6 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prkrip1Q9CWV6 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prkrip1Q9CWV6 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prkrip1Q9CWV6 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prkrip1Q9CWV6 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prkrip1Q9CWV6 Mixl1-201ENSMUST00000027778 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prkrip1Q9CWV6 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prkrip1Q9CWV6 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prkrip1Q9CWV6 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prkrip1Q9CWV6 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prkrip1Q9CWV6 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prkrip1Q9CWV6 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prkrip1Q9CWV6 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prkrip1Q9CWV6 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prkrip1Q9CWV6 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Prkrip1Q9CWV6 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prkrip1Q9CWV6 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prkrip1Q9CWV6 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prkrip1Q9CWV6 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Prkrip1Q9CWV6 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Prkrip1Q9CWV6 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prkrip1Q9CWV6 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prkrip1Q9CWV6 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prkrip1Q9CWV6 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms