Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
NubplQ9CWD8 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms