Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 Rab10os-203ENSMUST00000178074 4006 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 Fbn2-201ENSMUST00000025497 10480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rprd1bQ9CSU0 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
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