Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSN1

Snw1, SNW domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snw1Q9CSN1 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snw1Q9CSN1 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snw1Q9CSN1 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snw1Q9CSN1 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snw1Q9CSN1 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snw1Q9CSN1 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snw1Q9CSN1 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snw1Q9CSN1 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snw1Q9CSN1 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snw1Q9CSN1 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snw1Q9CSN1 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Snw1Q9CSN1 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Snw1Q9CSN1 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snw1Q9CSN1 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Snw1Q9CSN1 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snw1Q9CSN1 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snw1Q9CSN1 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snw1Q9CSN1 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snw1Q9CSN1 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snw1Q9CSN1 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snw1Q9CSN1 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snw1Q9CSN1 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snw1Q9CSN1 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snw1Q9CSN1 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snw1Q9CSN1 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snw1Q9CSN1 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snw1Q9CSN1 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snw1Q9CSN1 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snw1Q9CSN1 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snw1Q9CSN1 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snw1Q9CSN1 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snw1Q9CSN1 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snw1Q9CSN1 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snw1Q9CSN1 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snw1Q9CSN1 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snw1Q9CSN1 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snw1Q9CSN1 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snw1Q9CSN1 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snw1Q9CSN1 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Snw1Q9CSN1 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snw1Q9CSN1 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snw1Q9CSN1 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snw1Q9CSN1 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snw1Q9CSN1 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snw1Q9CSN1 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snw1Q9CSN1 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Snw1Q9CSN1 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snw1Q9CSN1 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snw1Q9CSN1 Ptpn7-203ENSMUST00000187985 1990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snw1Q9CSN1 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snw1Q9CSN1 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snw1Q9CSN1 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snw1Q9CSN1 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snw1Q9CSN1 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snw1Q9CSN1 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snw1Q9CSN1 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snw1Q9CSN1 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snw1Q9CSN1 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snw1Q9CSN1 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snw1Q9CSN1 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Snw1Q9CSN1 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snw1Q9CSN1 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snw1Q9CSN1 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snw1Q9CSN1 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snw1Q9CSN1 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snw1Q9CSN1 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Snw1Q9CSN1 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snw1Q9CSN1 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snw1Q9CSN1 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Snw1Q9CSN1 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snw1Q9CSN1 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snw1Q9CSN1 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snw1Q9CSN1 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snw1Q9CSN1 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snw1Q9CSN1 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snw1Q9CSN1 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snw1Q9CSN1 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snw1Q9CSN1 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snw1Q9CSN1 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snw1Q9CSN1 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snw1Q9CSN1 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snw1Q9CSN1 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snw1Q9CSN1 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snw1Q9CSN1 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snw1Q9CSN1 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snw1Q9CSN1 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snw1Q9CSN1 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snw1Q9CSN1 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snw1Q9CSN1 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snw1Q9CSN1 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Snw1Q9CSN1 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Snw1Q9CSN1 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Snw1Q9CSN1 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Snw1Q9CSN1 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Snw1Q9CSN1 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Snw1Q9CSN1 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Snw1Q9CSN1 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Snw1Q9CSN1 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Snw1Q9CSN1 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Snw1Q9CSN1 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
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