Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ0

Smim8, Small integral membrane protein 8, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim8Q9CQQ0 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Slc27a2-201ENSMUST00000061491 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Smim8Q9CQQ0 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Smim8Q9CQQ0 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
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Smim8Q9CQQ0 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 B3gat2-201ENSMUST00000063663 5655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
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Smim8Q9CQQ0 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Smim8Q9CQQ0 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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