Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQN7

Mrpl41, 39S ribosomal protein L41, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 135 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl41Q9CQN7 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mrpl41Q9CQN7 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mrpl41Q9CQN7 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mrpl41Q9CQN7 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mrpl41Q9CQN7 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mrpl41Q9CQN7 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mrpl41Q9CQN7 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mrpl41Q9CQN7 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mrpl41Q9CQN7 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mrpl41Q9CQN7 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mrpl41Q9CQN7 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl41Q9CQN7 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl41Q9CQN7 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl41Q9CQN7 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl41Q9CQN7 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl41Q9CQN7 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl41Q9CQN7 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl41Q9CQN7 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl41Q9CQN7 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl41Q9CQN7 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl41Q9CQN7 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl41Q9CQN7 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl41Q9CQN7 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl41Q9CQN7 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl41Q9CQN7 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl41Q9CQN7 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl41Q9CQN7 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl41Q9CQN7 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl41Q9CQN7 Map7-202ENSMUST00000116259 3831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl41Q9CQN7 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl41Q9CQN7 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl41Q9CQN7 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl41Q9CQN7 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl41Q9CQN7 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl41Q9CQN7 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl41Q9CQN7 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl41Q9CQN7 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl41Q9CQN7 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl41Q9CQN7 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl41Q9CQN7 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl41Q9CQN7 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl41Q9CQN7 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl41Q9CQN7 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl41Q9CQN7 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl41Q9CQN7 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl41Q9CQN7 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl41Q9CQN7 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl41Q9CQN7 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl41Q9CQN7 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl41Q9CQN7 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl41Q9CQN7 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl41Q9CQN7 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl41Q9CQN7 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl41Q9CQN7 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl41Q9CQN7 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl41Q9CQN7 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl41Q9CQN7 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl41Q9CQN7 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl41Q9CQN7 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl41Q9CQN7 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl41Q9CQN7 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl41Q9CQN7 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl41Q9CQN7 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Mrpl41Q9CQN7 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl41Q9CQN7 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl41Q9CQN7 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl41Q9CQN7 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl41Q9CQN7 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl41Q9CQN7 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl41Q9CQN7 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl41Q9CQN7 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl41Q9CQN7 Epb41l2-204ENSMUST00000217929 3621 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl41Q9CQN7 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl41Q9CQN7 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl41Q9CQN7 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl41Q9CQN7 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl41Q9CQN7 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl41Q9CQN7 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl41Q9CQN7 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl41Q9CQN7 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl41Q9CQN7 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl41Q9CQN7 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl41Q9CQN7 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl41Q9CQN7 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl41Q9CQN7 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl41Q9CQN7 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl41Q9CQN7 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl41Q9CQN7 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl41Q9CQN7 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl41Q9CQN7 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl41Q9CQN7 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl41Q9CQN7 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl41Q9CQN7 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl41Q9CQN7 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl41Q9CQN7 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl41Q9CQN7 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl41Q9CQN7 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl41Q9CQN7 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl41Q9CQN7 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Mrpl41Q9CQN7 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 135.9 ms