Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ1

Higd2a, HIG1 domain family member 2A, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd2aQ9CQJ1 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Higd2aQ9CQJ1 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms