Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC3

Protein C9orf135 homolog, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQC3 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q9CQC3 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q9CQC3 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q9CQC3 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q9CQC3 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Q9CQC3 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Q9CQC3 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q9CQC3 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q9CQC3 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q9CQC3 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q9CQC3 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q9CQC3 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q9CQC3 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q9CQC3 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q9CQC3 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q9CQC3 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q9CQC3 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q9CQC3 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q9CQC3 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q9CQC3 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Q9CQC3 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q9CQC3 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q9CQC3 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q9CQC3 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q9CQC3 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Q9CQC3 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q9CQC3 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q9CQC3 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q9CQC3 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q9CQC3 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q9CQC3 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Q9CQC3 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Q9CQC3 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q9CQC3 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Q9CQC3 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q9CQC3 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q9CQC3 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q9CQC3 Atp5d-201ENSMUST00000003156 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q9CQC3 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q9CQC3 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q9CQC3 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q9CQC3 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q9CQC3 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q9CQC3 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q9CQC3 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q9CQC3 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q9CQC3 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q9CQC3 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Q9CQC3 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q9CQC3 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Q9CQC3 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q9CQC3 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q9CQC3 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q9CQC3 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q9CQC3 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q9CQC3 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q9CQC3 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q9CQC3 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q9CQC3 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q9CQC3 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q9CQC3 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Q9CQC3 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Q9CQC3 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q9CQC3 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q9CQC3 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q9CQC3 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q9CQC3 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q9CQC3 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q9CQC3 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q9CQC3 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q9CQC3 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q9CQC3 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q9CQC3 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q9CQC3 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q9CQC3 Rnf220-202ENSMUST00000094853 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q9CQC3 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q9CQC3 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q9CQC3 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q9CQC3 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q9CQC3 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q9CQC3 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Q9CQC3 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q9CQC3 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q9CQC3 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q9CQC3 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q9CQC3 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q9CQC3 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q9CQC3 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q9CQC3 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q9CQC3 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q9CQC3 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q9CQC3 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q9CQC3 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q9CQC3 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q9CQC3 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q9CQC3 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q9CQC3 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q9CQC3 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q9CQC3 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Q9CQC3 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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