Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQA5

Med4, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med4Q9CQA5 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Med4Q9CQA5 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Med4Q9CQA5 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Med4Q9CQA5 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Med4Q9CQA5 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Med4Q9CQA5 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Med4Q9CQA5 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Med4Q9CQA5 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Med4Q9CQA5 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Med4Q9CQA5 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Med4Q9CQA5 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Med4Q9CQA5 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Med4Q9CQA5 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Med4Q9CQA5 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Med4Q9CQA5 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Med4Q9CQA5 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Med4Q9CQA5 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Med4Q9CQA5 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Med4Q9CQA5 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Med4Q9CQA5 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Med4Q9CQA5 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Med4Q9CQA5 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Med4Q9CQA5 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Med4Q9CQA5 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Med4Q9CQA5 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Med4Q9CQA5 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Med4Q9CQA5 Cd99l2-204ENSMUST00000114587 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Med4Q9CQA5 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Med4Q9CQA5 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Med4Q9CQA5 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Med4Q9CQA5 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Med4Q9CQA5 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Med4Q9CQA5 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Med4Q9CQA5 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Med4Q9CQA5 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Med4Q9CQA5 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Med4Q9CQA5 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Med4Q9CQA5 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Med4Q9CQA5 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Med4Q9CQA5 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Med4Q9CQA5 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Med4Q9CQA5 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Med4Q9CQA5 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Med4Q9CQA5 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Med4Q9CQA5 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Med4Q9CQA5 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Med4Q9CQA5 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Med4Q9CQA5 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Med4Q9CQA5 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Med4Q9CQA5 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Med4Q9CQA5 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Med4Q9CQA5 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Med4Q9CQA5 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Med4Q9CQA5 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Med4Q9CQA5 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Med4Q9CQA5 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Med4Q9CQA5 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Med4Q9CQA5 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Med4Q9CQA5 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Med4Q9CQA5 Gm12070-201ENSMUST00000119551 1002 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Med4Q9CQA5 Gm12671-201ENSMUST00000119978 1002 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Med4Q9CQA5 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Med4Q9CQA5 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Med4Q9CQA5 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Med4Q9CQA5 Gm10359-201ENSMUST00000180167 1002 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Med4Q9CQA5 Gm12033-201ENSMUST00000180654 1002 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Med4Q9CQA5 Gm5559-201ENSMUST00000180755 1002 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Med4Q9CQA5 Gm4335-201ENSMUST00000182581 1004 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Med4Q9CQA5 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Med4Q9CQA5 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Med4Q9CQA5 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Med4Q9CQA5 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Med4Q9CQA5 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Med4Q9CQA5 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Med4Q9CQA5 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Med4Q9CQA5 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Med4Q9CQA5 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Med4Q9CQA5 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Med4Q9CQA5 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Med4Q9CQA5 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Med4Q9CQA5 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Med4Q9CQA5 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Med4Q9CQA5 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Med4Q9CQA5 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Med4Q9CQA5 Srr-202ENSMUST00000108447 3138 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Med4Q9CQA5 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Med4Q9CQA5 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Med4Q9CQA5 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Med4Q9CQA5 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Med4Q9CQA5 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Med4Q9CQA5 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Med4Q9CQA5 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Med4Q9CQA5 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Med4Q9CQA5 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Med4Q9CQA5 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Med4Q9CQA5 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Med4Q9CQA5 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Med4Q9CQA5 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Med4Q9CQA5 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Med4Q9CQA5 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms