Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ18

Rnaseh2c, Ribonuclease H2 subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnaseh2cQ9CQ18 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rnaseh2cQ9CQ18 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rnaseh2cQ9CQ18 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rnaseh2cQ9CQ18 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rnaseh2cQ9CQ18 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rnaseh2cQ9CQ18 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rnaseh2cQ9CQ18 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rnaseh2cQ9CQ18 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rnaseh2cQ9CQ18 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rnaseh2cQ9CQ18 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rnaseh2cQ9CQ18 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rnaseh2cQ9CQ18 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rnaseh2cQ9CQ18 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rnaseh2cQ9CQ18 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rnaseh2cQ9CQ18 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rnaseh2cQ9CQ18 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rnaseh2cQ9CQ18 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rnaseh2cQ9CQ18 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rnaseh2cQ9CQ18 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rnaseh2cQ9CQ18 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rnaseh2cQ9CQ18 Kcnn2-201ENSMUST00000066890 3682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rnaseh2cQ9CQ18 Abca7-203ENSMUST00000171637 6638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rnaseh2cQ9CQ18 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rnaseh2cQ9CQ18 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rnaseh2cQ9CQ18 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rnaseh2cQ9CQ18 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Rnaseh2cQ9CQ18 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rnaseh2cQ9CQ18 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Rnaseh2cQ9CQ18 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rnaseh2cQ9CQ18 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rnaseh2cQ9CQ18 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rnaseh2cQ9CQ18 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rnaseh2cQ9CQ18 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rnaseh2cQ9CQ18 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rnaseh2cQ9CQ18 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Rnaseh2cQ9CQ18 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rnaseh2cQ9CQ18 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rnaseh2cQ9CQ18 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rnaseh2cQ9CQ18 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rnaseh2cQ9CQ18 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rnaseh2cQ9CQ18 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Rnaseh2cQ9CQ18 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rnaseh2cQ9CQ18 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rnaseh2cQ9CQ18 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rnaseh2cQ9CQ18 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rnaseh2cQ9CQ18 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rnaseh2cQ9CQ18 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Rnaseh2cQ9CQ18 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rnaseh2cQ9CQ18 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Rnaseh2cQ9CQ18 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Rnaseh2cQ9CQ18 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Rnaseh2cQ9CQ18 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rnaseh2cQ9CQ18 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rnaseh2cQ9CQ18 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Rnaseh2cQ9CQ18 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Rnaseh2cQ9CQ18 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rnaseh2cQ9CQ18 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rnaseh2cQ9CQ18 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rnaseh2cQ9CQ18 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rnaseh2cQ9CQ18 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rnaseh2cQ9CQ18 Sema4a-202ENSMUST00000107531 2897 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rnaseh2cQ9CQ18 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rnaseh2cQ9CQ18 Klhl18-201ENSMUST00000068025 4530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rnaseh2cQ9CQ18 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rnaseh2cQ9CQ18 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rnaseh2cQ9CQ18 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Rnaseh2cQ9CQ18 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnaseh2cQ9CQ18 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnaseh2cQ9CQ18 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnaseh2cQ9CQ18 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnaseh2cQ9CQ18 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnaseh2cQ9CQ18 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnaseh2cQ9CQ18 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnaseh2cQ9CQ18 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnaseh2cQ9CQ18 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnaseh2cQ9CQ18 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnaseh2cQ9CQ18 Rapgef6-202ENSMUST00000101206 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnaseh2cQ9CQ18 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnaseh2cQ9CQ18 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnaseh2cQ9CQ18 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnaseh2cQ9CQ18 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnaseh2cQ9CQ18 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnaseh2cQ9CQ18 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnaseh2cQ9CQ18 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnaseh2cQ9CQ18 Arhgap30-201ENSMUST00000056449 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Rnaseh2cQ9CQ18 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.7 ms