Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atg3Q9CPX6 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atg3Q9CPX6 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atg3Q9CPX6 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atg3Q9CPX6 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atg3Q9CPX6 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Atg3Q9CPX6 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg3Q9CPX6 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg3Q9CPX6 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg3Q9CPX6 Gm12176-201ENSMUST00000121420 875 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg3Q9CPX6 Cryzl1-204ENSMUST00000122254 845 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg3Q9CPX6 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg3Q9CPX6 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg3Q9CPX6 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg3Q9CPX6 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg3Q9CPX6 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg3Q9CPX6 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg3Q9CPX6 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg3Q9CPX6 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg3Q9CPX6 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg3Q9CPX6 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg3Q9CPX6 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg3Q9CPX6 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg3Q9CPX6 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg3Q9CPX6 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg3Q9CPX6 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg3Q9CPX6 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg3Q9CPX6 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg3Q9CPX6 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg3Q9CPX6 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg3Q9CPX6 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg3Q9CPX6 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg3Q9CPX6 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg3Q9CPX6 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg3Q9CPX6 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg3Q9CPX6 AI839979-202ENSMUST00000201790 1539 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg3Q9CPX6 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg3Q9CPX6 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg3Q9CPX6 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg3Q9CPX6 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg3Q9CPX6 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg3Q9CPX6 Gm14017-201ENSMUST00000121934 386 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg3Q9CPX6 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg3Q9CPX6 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg3Q9CPX6 Gm42838-201ENSMUST00000196503 439 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg3Q9CPX6 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg3Q9CPX6 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg3Q9CPX6 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg3Q9CPX6 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg3Q9CPX6 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg3Q9CPX6 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg3Q9CPX6 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg3Q9CPX6 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg3Q9CPX6 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg3Q9CPX6 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg3Q9CPX6 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg3Q9CPX6 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg3Q9CPX6 Serpinb6d-201ENSMUST00000059637 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg3Q9CPX6 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg3Q9CPX6 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg3Q9CPX6 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atg3Q9CPX6 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atg3Q9CPX6 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atg3Q9CPX6 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atg3Q9CPX6 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atg3Q9CPX6 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atg3Q9CPX6 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atg3Q9CPX6 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atg3Q9CPX6 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atg3Q9CPX6 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atg3Q9CPX6 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atg3Q9CPX6 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atg3Q9CPX6 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atg3Q9CPX6 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atg3Q9CPX6 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atg3Q9CPX6 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atg3Q9CPX6 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Atg3Q9CPX6 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atg3Q9CPX6 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atg3Q9CPX6 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Atg3Q9CPX6 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atg3Q9CPX6 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atg3Q9CPX6 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atg3Q9CPX6 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atg3Q9CPX6 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atg3Q9CPX6 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atg3Q9CPX6 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atg3Q9CPX6 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atg3Q9CPX6 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atg3Q9CPX6 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atg3Q9CPX6 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atg3Q9CPX6 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atg3Q9CPX6 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atg3Q9CPX6 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atg3Q9CPX6 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atg3Q9CPX6 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atg3Q9CPX6 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atg3Q9CPX6 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atg3Q9CPX6 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atg3Q9CPX6 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms