Protein–RNA interactions for Protein: Q99PS0

Krt23, Keratin, type I cytoskeletal 23, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt23Q99PS0 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krt23Q99PS0 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krt23Q99PS0 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krt23Q99PS0 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krt23Q99PS0 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krt23Q99PS0 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Krt23Q99PS0 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krt23Q99PS0 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Krt23Q99PS0 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krt23Q99PS0 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Krt23Q99PS0 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Krt23Q99PS0 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Krt23Q99PS0 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
Krt23Q99PS0 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krt23Q99PS0 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krt23Q99PS0 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krt23Q99PS0 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krt23Q99PS0 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krt23Q99PS0 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krt23Q99PS0 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Krt23Q99PS0 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krt23Q99PS0 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Krt23Q99PS0 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krt23Q99PS0 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krt23Q99PS0 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Krt23Q99PS0 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Krt23Q99PS0 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krt23Q99PS0 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Krt23Q99PS0 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krt23Q99PS0 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krt23Q99PS0 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krt23Q99PS0 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Krt23Q99PS0 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Krt23Q99PS0 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Krt23Q99PS0 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Krt23Q99PS0 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krt23Q99PS0 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krt23Q99PS0 Apc2-202ENSMUST00000105359 9173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Krt23Q99PS0 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krt23Q99PS0 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krt23Q99PS0 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krt23Q99PS0 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krt23Q99PS0 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krt23Q99PS0 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krt23Q99PS0 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krt23Q99PS0 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krt23Q99PS0 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krt23Q99PS0 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krt23Q99PS0 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krt23Q99PS0 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krt23Q99PS0 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krt23Q99PS0 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Krt23Q99PS0 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Krt23Q99PS0 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Krt23Q99PS0 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Krt23Q99PS0 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Krt23Q99PS0 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Krt23Q99PS0 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Krt23Q99PS0 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Krt23Q99PS0 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Krt23Q99PS0 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Krt23Q99PS0 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Krt23Q99PS0 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Krt23Q99PS0 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Krt23Q99PS0 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Krt23Q99PS0 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Krt23Q99PS0 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Krt23Q99PS0 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Krt23Q99PS0 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Krt23Q99PS0 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Krt23Q99PS0 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Krt23Q99PS0 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Krt23Q99PS0 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Krt23Q99PS0 Acad12-202ENSMUST00000111776 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Krt23Q99PS0 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Krt23Q99PS0 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Krt23Q99PS0 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Krt23Q99PS0 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Krt23Q99PS0 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Krt23Q99PS0 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Krt23Q99PS0 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Krt23Q99PS0 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Krt23Q99PS0 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Krt23Q99PS0 Rasl12-201ENSMUST00000085453 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Krt23Q99PS0 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Krt23Q99PS0 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Krt23Q99PS0 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Krt23Q99PS0 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Krt23Q99PS0 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Krt23Q99PS0 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Krt23Q99PS0 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Krt23Q99PS0 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Krt23Q99PS0 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Krt23Q99PS0 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Krt23Q99PS0 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Krt23Q99PS0 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Krt23Q99PS0 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Krt23Q99PS0 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Krt23Q99PS0 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Krt23Q99PS0 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms