Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF2

Nsmf, NMDA receptor synaptonuclear signaling and neuronal migration factor, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NsmfQ99NF2 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NsmfQ99NF2 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NsmfQ99NF2 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NsmfQ99NF2 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NsmfQ99NF2 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NsmfQ99NF2 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NsmfQ99NF2 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NsmfQ99NF2 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NsmfQ99NF2 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NsmfQ99NF2 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NsmfQ99NF2 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NsmfQ99NF2 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NsmfQ99NF2 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NsmfQ99NF2 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NsmfQ99NF2 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NsmfQ99NF2 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NsmfQ99NF2 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NsmfQ99NF2 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NsmfQ99NF2 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NsmfQ99NF2 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NsmfQ99NF2 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NsmfQ99NF2 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
NsmfQ99NF2 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NsmfQ99NF2 Gm19163-201ENSMUST00000223313 780 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
NsmfQ99NF2 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NsmfQ99NF2 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NsmfQ99NF2 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NsmfQ99NF2 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NsmfQ99NF2 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NsmfQ99NF2 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NsmfQ99NF2 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
NsmfQ99NF2 Gm16278-201ENSMUST00000148064 2071 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NsmfQ99NF2 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NsmfQ99NF2 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NsmfQ99NF2 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NsmfQ99NF2 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NsmfQ99NF2 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NsmfQ99NF2 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NsmfQ99NF2 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NsmfQ99NF2 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NsmfQ99NF2 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NsmfQ99NF2 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NsmfQ99NF2 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NsmfQ99NF2 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NsmfQ99NF2 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NsmfQ99NF2 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NsmfQ99NF2 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NsmfQ99NF2 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NsmfQ99NF2 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NsmfQ99NF2 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NsmfQ99NF2 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NsmfQ99NF2 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NsmfQ99NF2 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NsmfQ99NF2 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NsmfQ99NF2 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NsmfQ99NF2 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NsmfQ99NF2 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NsmfQ99NF2 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NsmfQ99NF2 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NsmfQ99NF2 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NsmfQ99NF2 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NsmfQ99NF2 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NsmfQ99NF2 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NsmfQ99NF2 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NsmfQ99NF2 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NsmfQ99NF2 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NsmfQ99NF2 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NsmfQ99NF2 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NsmfQ99NF2 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NsmfQ99NF2 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NsmfQ99NF2 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NsmfQ99NF2 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NsmfQ99NF2 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NsmfQ99NF2 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
NsmfQ99NF2 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NsmfQ99NF2 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NsmfQ99NF2 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
NsmfQ99NF2 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
NsmfQ99NF2 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NsmfQ99NF2 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NsmfQ99NF2 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NsmfQ99NF2 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NsmfQ99NF2 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NsmfQ99NF2 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NsmfQ99NF2 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NsmfQ99NF2 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NsmfQ99NF2 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NsmfQ99NF2 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NsmfQ99NF2 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NsmfQ99NF2 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NsmfQ99NF2 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NsmfQ99NF2 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
NsmfQ99NF2 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NsmfQ99NF2 Gm11637-201ENSMUST00000120601 592 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NsmfQ99NF2 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NsmfQ99NF2 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
NsmfQ99NF2 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NsmfQ99NF2 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NsmfQ99NF2 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
NsmfQ99NF2 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.7 ms