Protein–RNA interactions for Protein: Q99MB3

Tm2d1, TM2 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm2d1Q99MB3 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tm2d1Q99MB3 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tm2d1Q99MB3 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tm2d1Q99MB3 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tm2d1Q99MB3 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tm2d1Q99MB3 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tm2d1Q99MB3 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Tm2d1Q99MB3 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tm2d1Q99MB3 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Tm2d1Q99MB3 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tm2d1Q99MB3 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tm2d1Q99MB3 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tm2d1Q99MB3 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tm2d1Q99MB3 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tm2d1Q99MB3 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tm2d1Q99MB3 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tm2d1Q99MB3 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tm2d1Q99MB3 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tm2d1Q99MB3 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tm2d1Q99MB3 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tm2d1Q99MB3 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tm2d1Q99MB3 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tm2d1Q99MB3 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tm2d1Q99MB3 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tm2d1Q99MB3 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tm2d1Q99MB3 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Tm2d1Q99MB3 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Tm2d1Q99MB3 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tm2d1Q99MB3 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tm2d1Q99MB3 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tm2d1Q99MB3 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tm2d1Q99MB3 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tm2d1Q99MB3 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Tm2d1Q99MB3 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Tm2d1Q99MB3 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tm2d1Q99MB3 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tm2d1Q99MB3 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tm2d1Q99MB3 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tm2d1Q99MB3 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tm2d1Q99MB3 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tm2d1Q99MB3 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tm2d1Q99MB3 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tm2d1Q99MB3 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tm2d1Q99MB3 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tm2d1Q99MB3 Apbb2-203ENSMUST00000159512 6632 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tm2d1Q99MB3 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tm2d1Q99MB3 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tm2d1Q99MB3 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tm2d1Q99MB3 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tm2d1Q99MB3 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tm2d1Q99MB3 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tm2d1Q99MB3 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tm2d1Q99MB3 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Tm2d1Q99MB3 Mslnl-201ENSMUST00000047098 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tm2d1Q99MB3 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.75
Tm2d1Q99MB3 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tm2d1Q99MB3 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tm2d1Q99MB3 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tm2d1Q99MB3 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tm2d1Q99MB3 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tm2d1Q99MB3 Pex2-204ENSMUST00000165309 2038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tm2d1Q99MB3 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tm2d1Q99MB3 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tm2d1Q99MB3 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Tm2d1Q99MB3 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tm2d1Q99MB3 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tm2d1Q99MB3 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tm2d1Q99MB3 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tm2d1Q99MB3 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tm2d1Q99MB3 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tm2d1Q99MB3 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tm2d1Q99MB3 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tm2d1Q99MB3 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tm2d1Q99MB3 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Tm2d1Q99MB3 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tm2d1Q99MB3 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tm2d1Q99MB3 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tm2d1Q99MB3 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Tm2d1Q99MB3 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC10.33□□□□□ -0.76
Tm2d1Q99MB3 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tm2d1Q99MB3 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tm2d1Q99MB3 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tm2d1Q99MB3 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tm2d1Q99MB3 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tm2d1Q99MB3 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tm2d1Q99MB3 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tm2d1Q99MB3 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tm2d1Q99MB3 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tm2d1Q99MB3 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tm2d1Q99MB3 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tm2d1Q99MB3 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tm2d1Q99MB3 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tm2d1Q99MB3 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tm2d1Q99MB3 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tm2d1Q99MB3 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tm2d1Q99MB3 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tm2d1Q99MB3 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tm2d1Q99MB3 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tm2d1Q99MB3 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.33□□□□□ -0.76
Tm2d1Q99MB3 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
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