Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ7

Rcbtb2, RCC1 and BTB domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcbtb2Q99LJ7 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rcbtb2Q99LJ7 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rcbtb2Q99LJ7 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rcbtb2Q99LJ7 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rcbtb2Q99LJ7 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rcbtb2Q99LJ7 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rcbtb2Q99LJ7 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rcbtb2Q99LJ7 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Rcbtb2Q99LJ7 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Rcbtb2Q99LJ7 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rcbtb2Q99LJ7 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rcbtb2Q99LJ7 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rcbtb2Q99LJ7 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rcbtb2Q99LJ7 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rcbtb2Q99LJ7 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Rcbtb2Q99LJ7 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rcbtb2Q99LJ7 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rcbtb2Q99LJ7 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rcbtb2Q99LJ7 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rcbtb2Q99LJ7 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rcbtb2Q99LJ7 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rcbtb2Q99LJ7 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rcbtb2Q99LJ7 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rcbtb2Q99LJ7 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rcbtb2Q99LJ7 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rcbtb2Q99LJ7 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rcbtb2Q99LJ7 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rcbtb2Q99LJ7 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rcbtb2Q99LJ7 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rcbtb2Q99LJ7 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Rcbtb2Q99LJ7 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rcbtb2Q99LJ7 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rcbtb2Q99LJ7 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rcbtb2Q99LJ7 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rcbtb2Q99LJ7 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rcbtb2Q99LJ7 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rcbtb2Q99LJ7 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rcbtb2Q99LJ7 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rcbtb2Q99LJ7 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rcbtb2Q99LJ7 Rbm20-204ENSMUST00000164202 6592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rcbtb2Q99LJ7 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rcbtb2Q99LJ7 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rcbtb2Q99LJ7 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rcbtb2Q99LJ7 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rcbtb2Q99LJ7 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rcbtb2Q99LJ7 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rcbtb2Q99LJ7 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rcbtb2Q99LJ7 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rcbtb2Q99LJ7 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rcbtb2Q99LJ7 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rcbtb2Q99LJ7 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rcbtb2Q99LJ7 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Rcbtb2Q99LJ7 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rcbtb2Q99LJ7 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Rcbtb2Q99LJ7 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rcbtb2Q99LJ7 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rcbtb2Q99LJ7 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rcbtb2Q99LJ7 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rcbtb2Q99LJ7 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rcbtb2Q99LJ7 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Rcbtb2Q99LJ7 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rcbtb2Q99LJ7 Foxo6os-201ENSMUST00000152384 2291 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rcbtb2Q99LJ7 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rcbtb2Q99LJ7 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rcbtb2Q99LJ7 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rcbtb2Q99LJ7 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Rcbtb2Q99LJ7 Rps6kb1-207ENSMUST00000154617 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rcbtb2Q99LJ7 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rcbtb2Q99LJ7 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rcbtb2Q99LJ7 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rcbtb2Q99LJ7 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rcbtb2Q99LJ7 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rcbtb2Q99LJ7 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rcbtb2Q99LJ7 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rcbtb2Q99LJ7 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rcbtb2Q99LJ7 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Rcbtb2Q99LJ7 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Rcbtb2Q99LJ7 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rcbtb2Q99LJ7 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rcbtb2Q99LJ7 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rcbtb2Q99LJ7 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Rcbtb2Q99LJ7 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Rcbtb2Q99LJ7 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rcbtb2Q99LJ7 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Rcbtb2Q99LJ7 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rcbtb2Q99LJ7 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rcbtb2Q99LJ7 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rcbtb2Q99LJ7 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rcbtb2Q99LJ7 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Rcbtb2Q99LJ7 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Rcbtb2Q99LJ7 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Rcbtb2Q99LJ7 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Rcbtb2Q99LJ7 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Rcbtb2Q99LJ7 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Rcbtb2Q99LJ7 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Rcbtb2Q99LJ7 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Rcbtb2Q99LJ7 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Rcbtb2Q99LJ7 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Rcbtb2Q99LJ7 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Rcbtb2Q99LJ7 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.5 ms