Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY1

Tirap, Toll/interleukin-1 receptor domain-containing adapter protein, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TirapQ99JY1 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TirapQ99JY1 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
TirapQ99JY1 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TirapQ99JY1 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TirapQ99JY1 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
TirapQ99JY1 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
TirapQ99JY1 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TirapQ99JY1 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TirapQ99JY1 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TirapQ99JY1 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
TirapQ99JY1 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
TirapQ99JY1 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
TirapQ99JY1 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
TirapQ99JY1 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
TirapQ99JY1 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
TirapQ99JY1 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
TirapQ99JY1 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
TirapQ99JY1 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
TirapQ99JY1 CT009495.1-201ENSMUST00000224221 862 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
TirapQ99JY1 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
TirapQ99JY1 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TirapQ99JY1 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TirapQ99JY1 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TirapQ99JY1 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TirapQ99JY1 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TirapQ99JY1 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TirapQ99JY1 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TirapQ99JY1 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TirapQ99JY1 Tiparp-201ENSMUST00000047906 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TirapQ99JY1 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TirapQ99JY1 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TirapQ99JY1 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TirapQ99JY1 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TirapQ99JY1 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TirapQ99JY1 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TirapQ99JY1 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TirapQ99JY1 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
TirapQ99JY1 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
TirapQ99JY1 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TirapQ99JY1 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
TirapQ99JY1 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
TirapQ99JY1 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
TirapQ99JY1 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
TirapQ99JY1 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TirapQ99JY1 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TirapQ99JY1 Cyp2s1-202ENSMUST00000108395 3161 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TirapQ99JY1 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TirapQ99JY1 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
TirapQ99JY1 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TirapQ99JY1 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
TirapQ99JY1 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TirapQ99JY1 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
TirapQ99JY1 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TirapQ99JY1 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
TirapQ99JY1 Zcwpw1-201ENSMUST00000035852 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TirapQ99JY1 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TirapQ99JY1 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TirapQ99JY1 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TirapQ99JY1 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
TirapQ99JY1 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TirapQ99JY1 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TirapQ99JY1 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
TirapQ99JY1 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TirapQ99JY1 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TirapQ99JY1 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
TirapQ99JY1 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TirapQ99JY1 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TirapQ99JY1 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
TirapQ99JY1 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TirapQ99JY1 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TirapQ99JY1 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TirapQ99JY1 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
TirapQ99JY1 Gm37629-201ENSMUST00000193635 1050 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
TirapQ99JY1 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
TirapQ99JY1 Gm5708-201ENSMUST00000196289 886 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
TirapQ99JY1 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
TirapQ99JY1 AC172027.1-201ENSMUST00000217659 337 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
TirapQ99JY1 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TirapQ99JY1 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
TirapQ99JY1 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TirapQ99JY1 1700030K09Rik-202ENSMUST00000121902 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
TirapQ99JY1 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TirapQ99JY1 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TirapQ99JY1 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TirapQ99JY1 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TirapQ99JY1 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TirapQ99JY1 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TirapQ99JY1 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TirapQ99JY1 Lrtm2-204ENSMUST00000168793 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
TirapQ99JY1 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TirapQ99JY1 Gm10829-201ENSMUST00000202084 2988 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
TirapQ99JY1 Nufip2-204ENSMUST00000181023 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TirapQ99JY1 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TirapQ99JY1 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TirapQ99JY1 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TirapQ99JY1 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TirapQ99JY1 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
TirapQ99JY1 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TirapQ99JY1 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
TirapQ99JY1 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.8 ms