Protein–RNA interactions for Protein: Q99J38

Ttc30a1, Tetratricopeptide repeat protein 30A1, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc30a1Q99J38 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc30a1Q99J38 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc30a1Q99J38 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc30a1Q99J38 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc30a1Q99J38 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc30a1Q99J38 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc30a1Q99J38 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc30a1Q99J38 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc30a1Q99J38 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc30a1Q99J38 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc30a1Q99J38 Slc23a4-201ENSMUST00000044387 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc30a1Q99J38 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc30a1Q99J38 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc30a1Q99J38 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc30a1Q99J38 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc30a1Q99J38 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc30a1Q99J38 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc30a1Q99J38 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc30a1Q99J38 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc30a1Q99J38 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc30a1Q99J38 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc30a1Q99J38 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc30a1Q99J38 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc30a1Q99J38 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc30a1Q99J38 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc30a1Q99J38 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc30a1Q99J38 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc30a1Q99J38 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc30a1Q99J38 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc30a1Q99J38 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc30a1Q99J38 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc30a1Q99J38 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc30a1Q99J38 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc30a1Q99J38 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc30a1Q99J38 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc30a1Q99J38 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
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Ttc30a1Q99J38 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc30a1Q99J38 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc30a1Q99J38 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc30a1Q99J38 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc30a1Q99J38 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
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Ttc30a1Q99J38 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc30a1Q99J38 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc30a1Q99J38 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc30a1Q99J38 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc30a1Q99J38 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc30a1Q99J38 C5ar1-201ENSMUST00000050770 2481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc30a1Q99J38 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc30a1Q99J38 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc30a1Q99J38 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc30a1Q99J38 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc30a1Q99J38 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc30a1Q99J38 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc30a1Q99J38 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc30a1Q99J38 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc30a1Q99J38 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc30a1Q99J38 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
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Ttc30a1Q99J38 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc30a1Q99J38 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc30a1Q99J38 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc30a1Q99J38 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc30a1Q99J38 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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Ttc30a1Q99J38 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc30a1Q99J38 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc30a1Q99J38 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc30a1Q99J38 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc30a1Q99J38 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc30a1Q99J38 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc30a1Q99J38 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc30a1Q99J38 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc30a1Q99J38 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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Ttc30a1Q99J38 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc30a1Q99J38 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc30a1Q99J38 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc30a1Q99J38 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc30a1Q99J38 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc30a1Q99J38 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc30a1Q99J38 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc30a1Q99J38 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc30a1Q99J38 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc30a1Q99J38 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc30a1Q99J38 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc30a1Q99J38 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc30a1Q99J38 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc30a1Q99J38 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc30a1Q99J38 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc30a1Q99J38 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc30a1Q99J38 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc30a1Q99J38 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc30a1Q99J38 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc30a1Q99J38 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc30a1Q99J38 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
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