Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Gm43650-201ENSMUST00000197337 1382 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Gm16534-201ENSMUST00000149300 1492 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Tmem116-201ENSMUST00000031405 1288 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Cldn16Q925N4 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
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