Protein–RNA interactions for Protein: Q925F3

Rnf144a, E3 ubiquitin-protein ligase RNF144A, mousemouse

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Length 292 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf144aQ925F3 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Rnf144aQ925F3 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf144aQ925F3 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf144aQ925F3 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf144aQ925F3 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf144aQ925F3 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf144aQ925F3 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
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Rnf144aQ925F3 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf144aQ925F3 Gm13859-201ENSMUST00000119936 1423 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf144aQ925F3 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Rnf144aQ925F3 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf144aQ925F3 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Rnf144aQ925F3 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf144aQ925F3 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf144aQ925F3 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf144aQ925F3 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf144aQ925F3 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf144aQ925F3 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf144aQ925F3 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf144aQ925F3 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf144aQ925F3 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf144aQ925F3 Nrf1-210ENSMUST00000115211 3295 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Rnf144aQ925F3 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf144aQ925F3 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Rnf144aQ925F3 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Rnf144aQ925F3 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf144aQ925F3 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf144aQ925F3 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf144aQ925F3 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf144aQ925F3 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Rnf144aQ925F3 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Rnf144aQ925F3 Cep164-201ENSMUST00000117194 5541 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Rnf144aQ925F3 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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Rnf144aQ925F3 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf144aQ925F3 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Rnf144aQ925F3 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Rnf144aQ925F3 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf144aQ925F3 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf144aQ925F3 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf144aQ925F3 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf144aQ925F3 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf144aQ925F3 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf144aQ925F3 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf144aQ925F3 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf144aQ925F3 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf144aQ925F3 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf144aQ925F3 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf144aQ925F3 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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Rnf144aQ925F3 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf144aQ925F3 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf144aQ925F3 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf144aQ925F3 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf144aQ925F3 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Rnf144aQ925F3 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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