Protein–RNA interactions for Protein: Q920D3

Med28, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 28, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med28Q920D3 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Ahsa2-202ENSMUST00000109539 3583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Sowahc-201ENSMUST00000182161 4482 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Rtn4-202ENSMUST00000078830 3615 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Med28Q920D3 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Med28Q920D3 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Med28Q920D3 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Med28Q920D3 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Med28Q920D3 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Med28Q920D3 Tspyl4-201ENSMUST00000047935 3879 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Med28Q920D3 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Med28Q920D3 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Med28Q920D3 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Med28Q920D3 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Med28Q920D3 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Med28Q920D3 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Med28Q920D3 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Med28Q920D3 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Med28Q920D3 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Med28Q920D3 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Med28Q920D3 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Med28Q920D3 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Med28Q920D3 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Med28Q920D3 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Med28Q920D3 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Med28Q920D3 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Med28Q920D3 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Med28Q920D3 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Med28Q920D3 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Med28Q920D3 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Med28Q920D3 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Med28Q920D3 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Med28Q920D3 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Med28Q920D3 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Med28Q920D3 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Med28Q920D3 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Med28Q920D3 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Med28Q920D3 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.1 ms