Protein–RNA interactions for Protein: Q91YR7

Prpf6, Pre-mRNA-processing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 941 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf6Q91YR7 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prpf6Q91YR7 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prpf6Q91YR7 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Prpf6Q91YR7 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Prpf6Q91YR7 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prpf6Q91YR7 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prpf6Q91YR7 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prpf6Q91YR7 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prpf6Q91YR7 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prpf6Q91YR7 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prpf6Q91YR7 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prpf6Q91YR7 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prpf6Q91YR7 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Prpf6Q91YR7 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Prpf6Q91YR7 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prpf6Q91YR7 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prpf6Q91YR7 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prpf6Q91YR7 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prpf6Q91YR7 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Prpf6Q91YR7 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prpf6Q91YR7 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prpf6Q91YR7 Cops5-201ENSMUST00000027050 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prpf6Q91YR7 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prpf6Q91YR7 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prpf6Q91YR7 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prpf6Q91YR7 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prpf6Q91YR7 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prpf6Q91YR7 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prpf6Q91YR7 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prpf6Q91YR7 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prpf6Q91YR7 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prpf6Q91YR7 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prpf6Q91YR7 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prpf6Q91YR7 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Prpf6Q91YR7 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prpf6Q91YR7 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prpf6Q91YR7 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prpf6Q91YR7 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prpf6Q91YR7 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prpf6Q91YR7 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prpf6Q91YR7 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prpf6Q91YR7 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prpf6Q91YR7 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prpf6Q91YR7 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prpf6Q91YR7 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prpf6Q91YR7 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prpf6Q91YR7 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prpf6Q91YR7 Tomm5-204ENSMUST00000107810 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prpf6Q91YR7 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Prpf6Q91YR7 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prpf6Q91YR7 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prpf6Q91YR7 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prpf6Q91YR7 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Prpf6Q91YR7 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prpf6Q91YR7 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Prpf6Q91YR7 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prpf6Q91YR7 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prpf6Q91YR7 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prpf6Q91YR7 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prpf6Q91YR7 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prpf6Q91YR7 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prpf6Q91YR7 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prpf6Q91YR7 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prpf6Q91YR7 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prpf6Q91YR7 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prpf6Q91YR7 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prpf6Q91YR7 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prpf6Q91YR7 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prpf6Q91YR7 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prpf6Q91YR7 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prpf6Q91YR7 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prpf6Q91YR7 Commd1-201ENSMUST00000057843 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prpf6Q91YR7 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prpf6Q91YR7 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prpf6Q91YR7 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Prpf6Q91YR7 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prpf6Q91YR7 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prpf6Q91YR7 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prpf6Q91YR7 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prpf6Q91YR7 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prpf6Q91YR7 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prpf6Q91YR7 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Prpf6Q91YR7 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Prpf6Q91YR7 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prpf6Q91YR7 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prpf6Q91YR7 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Prpf6Q91YR7 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prpf6Q91YR7 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prpf6Q91YR7 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prpf6Q91YR7 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prpf6Q91YR7 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prpf6Q91YR7 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Prpf6Q91YR7 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Prpf6Q91YR7 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Prpf6Q91YR7 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prpf6Q91YR7 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Prpf6Q91YR7 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Prpf6Q91YR7 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prpf6Q91YR7 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Prpf6Q91YR7 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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