Protein–RNA interactions for Protein: Q91WE1

Snx15, Sorting nexin-15, mousemouse

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Length 337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx15Q91WE1 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snx15Q91WE1 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snx15Q91WE1 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snx15Q91WE1 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snx15Q91WE1 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snx15Q91WE1 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Snx15Q91WE1 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snx15Q91WE1 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snx15Q91WE1 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snx15Q91WE1 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snx15Q91WE1 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snx15Q91WE1 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snx15Q91WE1 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snx15Q91WE1 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snx15Q91WE1 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snx15Q91WE1 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Snx15Q91WE1 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snx15Q91WE1 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Snx15Q91WE1 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snx15Q91WE1 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snx15Q91WE1 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snx15Q91WE1 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snx15Q91WE1 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snx15Q91WE1 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snx15Q91WE1 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snx15Q91WE1 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Snx15Q91WE1 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snx15Q91WE1 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snx15Q91WE1 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snx15Q91WE1 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Snx15Q91WE1 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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Snx15Q91WE1 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Snx15Q91WE1 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx15Q91WE1 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx15Q91WE1 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Snx15Q91WE1 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx15Q91WE1 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx15Q91WE1 Srd5a1-202ENSMUST00000091514 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Snx15Q91WE1 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx15Q91WE1 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
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Snx15Q91WE1 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx15Q91WE1 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx15Q91WE1 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx15Q91WE1 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx15Q91WE1 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx15Q91WE1 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx15Q91WE1 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx15Q91WE1 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx15Q91WE1 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx15Q91WE1 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx15Q91WE1 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx15Q91WE1 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx15Q91WE1 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx15Q91WE1 Tagln2-201ENSMUST00000111228 716 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx15Q91WE1 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx15Q91WE1 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx15Q91WE1 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx15Q91WE1 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx15Q91WE1 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx15Q91WE1 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Snx15Q91WE1 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms