Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHC5

Cabp4, Calcium-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp4Q8VHC5 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cabp4Q8VHC5 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cabp4Q8VHC5 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cabp4Q8VHC5 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cabp4Q8VHC5 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cabp4Q8VHC5 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cabp4Q8VHC5 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cabp4Q8VHC5 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cabp4Q8VHC5 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cabp4Q8VHC5 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cabp4Q8VHC5 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cabp4Q8VHC5 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cabp4Q8VHC5 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cabp4Q8VHC5 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cabp4Q8VHC5 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cabp4Q8VHC5 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Cabp4Q8VHC5 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Cabp4Q8VHC5 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cabp4Q8VHC5 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cabp4Q8VHC5 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cabp4Q8VHC5 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Cabp4Q8VHC5 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cabp4Q8VHC5 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cabp4Q8VHC5 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Cabp4Q8VHC5 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cabp4Q8VHC5 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cabp4Q8VHC5 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cabp4Q8VHC5 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cabp4Q8VHC5 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cabp4Q8VHC5 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cabp4Q8VHC5 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cabp4Q8VHC5 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cabp4Q8VHC5 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cabp4Q8VHC5 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cabp4Q8VHC5 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cabp4Q8VHC5 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cabp4Q8VHC5 Dnajb5-203ENSMUST00000098112 3093 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cabp4Q8VHC5 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cabp4Q8VHC5 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cabp4Q8VHC5 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Cabp4Q8VHC5 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cabp4Q8VHC5 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Cabp4Q8VHC5 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cabp4Q8VHC5 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cabp4Q8VHC5 Gm13850-201ENSMUST00000140465 623 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cabp4Q8VHC5 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cabp4Q8VHC5 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cabp4Q8VHC5 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cabp4Q8VHC5 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cabp4Q8VHC5 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Cabp4Q8VHC5 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cabp4Q8VHC5 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cabp4Q8VHC5 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cabp4Q8VHC5 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cabp4Q8VHC5 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cabp4Q8VHC5 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cabp4Q8VHC5 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cabp4Q8VHC5 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cabp4Q8VHC5 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Cabp4Q8VHC5 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cabp4Q8VHC5 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cabp4Q8VHC5 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cabp4Q8VHC5 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cabp4Q8VHC5 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cabp4Q8VHC5 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cabp4Q8VHC5 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Cabp4Q8VHC5 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Cabp4Q8VHC5 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cabp4Q8VHC5 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cabp4Q8VHC5 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Cabp4Q8VHC5 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cabp4Q8VHC5 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cabp4Q8VHC5 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cabp4Q8VHC5 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cabp4Q8VHC5 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cabp4Q8VHC5 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cabp4Q8VHC5 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cabp4Q8VHC5 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cabp4Q8VHC5 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cabp4Q8VHC5 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Cabp4Q8VHC5 Gm4577-201ENSMUST00000135203 716 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cabp4Q8VHC5 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cabp4Q8VHC5 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Cabp4Q8VHC5 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Cabp4Q8VHC5 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cabp4Q8VHC5 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cabp4Q8VHC5 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cabp4Q8VHC5 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cabp4Q8VHC5 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cabp4Q8VHC5 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cabp4Q8VHC5 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cabp4Q8VHC5 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cabp4Q8VHC5 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cabp4Q8VHC5 Nup93-201ENSMUST00000079961 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cabp4Q8VHC5 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cabp4Q8VHC5 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cabp4Q8VHC5 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cabp4Q8VHC5 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cabp4Q8VHC5 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cabp4Q8VHC5 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms