Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD57

Sft2d2, Vesicle transport protein SFT2B, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d2Q8VD57 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Sft2d2Q8VD57 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Slc6a6-201ENSMUST00000032185 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Sft2d2Q8VD57 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.3 ms